50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2111 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 167 aa  323  6e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  35.22 
 
 		 187 aa  84.7  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  46.23 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  31.14 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  36.88 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1036  peptidase A24A prepilin type IV  38.1 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  35.19 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  34.15 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  40.12 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  34.9 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  35.16 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  33.99 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2480  peptidase A24A prepilin type IV  31.61 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139077 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  31.87 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  35.1 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  34.62 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  35.1 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2358  hypothetical protein  38.92 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  35.1 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  32.48 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  33.73 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  34.15 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  33.73 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  33.73 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  42.72 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  42.72 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  28.3 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  32.78 
 
 		 186 aa  51.6  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2362  peptidase A24A, prepilin type IV  34.71 
 
 		 194 aa  50.8  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  27.88 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  39.36 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7226  peptidase A24A prepilin type IV  36.46 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.22284 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  38.36 
 
 		 218 aa  48.5  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  32.42 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2743  peptidase A24A prepilin type IV  38.55 
 
 		 196 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  30.64 
 
 		 192 aa  47.8  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  43.84 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0657  prepilin peptidase transmembrane protein  34.69 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6385  normal  0.502412 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2801  putative prepilin peptidase transmembrane protein, CpaA like  42.11 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  31.07 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  38.3 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  38.3 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  38.3 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5406  peptidase A24A, prepilin type IV  34.4 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  37.6 
 
 		 166 aa  44.7  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  27.92 
 
 		 151 aa  44.3  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  45.65 
 
 		 299 aa  43.9  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  37.5 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  30.95 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  33.7 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>