65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1170 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 189 aa  372  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  37.57 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  42.94 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2358  hypothetical protein  40.59 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  39.66 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  32.92 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  34.5 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  35.48 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  35.75 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  35.75 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  35.75 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2480  peptidase A24A prepilin type IV  31.71 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  36.02 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  36.05 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2743  peptidase A24A prepilin type IV  36.57 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  36.78 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  35.56 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  36.88 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  31.65 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  36.42 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  36.42 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  36.42 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  36.25 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  39.09 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  33.33 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  35.09 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  40.18 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0512  peptidase A24A prepilin type IV  27.91 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000304579  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  34.52 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7226  peptidase A24A prepilin type IV  31.17 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.22284 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  33.74 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1036  peptidase A24A prepilin type IV  34.48 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  28.39 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  29.94 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  32.03 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0657  prepilin peptidase transmembrane protein  34.66 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6385  normal  0.502412 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  33.33 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  30.71 
 
 		 260 aa  48.5  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  27.43 
 
 		 175 aa  48.5  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  36.22 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  32 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  32 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1561  peptidase A24A domain protein  34.15 
 
 		 261 aa  46.2  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  34.23 
 
 		 287 aa  46.2  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  34.38 
 
 		 266 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  34.38 
 
 		 266 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  34.23 
 
 		 287 aa  46.2  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  33.05 
 
 		 166 aa  45.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1745  Flp pilus assembly protein, protease CpaA  35.17 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0545  prepilin peptidase CpaA  27.64 
 
 		 142 aa  45.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1980  peptidase A24A prepilin type IV  34.48 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175431  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  33.94 
 
 		 287 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  34.13 
 
 		 296 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  33.33 
 
 		 274 aa  43.9  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  35.43 
 
 		 300 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  32.09 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  30.84 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.14 
 
 		 280 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  32.74 
 
 		 287 aa  42.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  40.95 
 
 		 255 aa  42  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  36.73 
 
 		 246 aa  42  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.34 
 
 		 259 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5627  peptidase A24A prepilin type IV  30.41 
 
 		 187 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0178766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  32.17 
 
 		 274 aa  41.6  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0149  peptidase A24A domain-containing protein  30.84 
 
 		 306 aa  41.2  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>