75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0550 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 179 aa  342  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0657  prepilin peptidase transmembrane protein  59.09 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6385  normal  0.502412 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  45.96 
 
 		 179 aa  108  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  44.1 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  47.85 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  47.85 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  47.83 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  44.1 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  44.1 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  47.24 
 
 		 179 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  40.25 
 
 		 178 aa  97.4  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  47.53 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  38.99 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  46.91 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  41.51 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  37.5 
 
 		 190 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  40 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  42.14 
 
 		 167 aa  84.7  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  38.41 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  34.57 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  36.25 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  35.38 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  27.49 
 
 		 183 aa  62  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  30.73 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  30.73 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  41.82 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1036  peptidase A24A prepilin type IV  38.69 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  34.5 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  34.15 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  37.58 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  44.3 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  32.14 
 
 		 218 aa  51.2  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2358  hypothetical protein  34.57 
 
 		 185 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  44.86 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4443  peptidase A24A prepilin type IV  35.09 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  44.74 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  44.74 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  44.74 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0545  prepilin peptidase CpaA  38.46 
 
 		 142 aa  48.5  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  39.42 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0149  peptidase A24A domain-containing protein  28.91 
 
 		 306 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  33.58 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  38.61 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  38.61 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  38.61 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  38.61 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  38.61 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  38.61 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  29.94 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1745  Flp pilus assembly protein, protease CpaA  31.29 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0538  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  37.4 
 
 		 250 aa  45.1  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.82 
 
 		 281 aa  45.1  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  28.57 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0512  peptidase A24A prepilin type IV  34.21 
 
 		 167 aa  44.7  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000304579  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  37.86 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  61.9 
 
 		 175 aa  44.7  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3485  peptidase A24A prepilin type IV  32.08 
 
 		 162 aa  44.3  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  32.7 
 
 		 274 aa  44.3  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3759  peptidase A24A, prepilin type IV  38.83 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal  0.405362 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  30.99 
 
 		 287 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55800  hypothetical protein  25.18 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  30.99 
 
 		 287 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7226  peptidase A24A prepilin type IV  37.12 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.22284 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  32.52 
 
 		 165 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  30.29 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  32.47 
 
 		 188 aa  42  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  29.77 
 
 		 250 aa  42  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0620  peptidase A24A prepilin type IV  33.06 
 
 		 156 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450509 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2397  peptidase A24A, prepilin type IV  42.31 
 
 		 133 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  31.19 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  31.48 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2350  peptidase A24A, prepilin type IV  42.31 
 
 		 133 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.747166  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5406  peptidase A24A, prepilin type IV  30.07 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2391  peptidase A24A, prepilin type IV  42.31 
 
 		 133 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.300874  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  31.9 
 
 		 151 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>