44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1745 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1745  Flp pilus assembly protein, protease CpaA  100 
 
 		 202 aa  401  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0545  prepilin peptidase CpaA  36.59 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  35.17 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  31.41 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  47.17 
 
 		 145 aa  74.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  31.29 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  35.71 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  31.79 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  37.84 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  33.54 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  33.11 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2480  peptidase A24A prepilin type IV  32.43 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139077 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  32.65 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  32.65 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  33.56 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  32.65 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  31.29 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  33.11 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  29.65 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1036  peptidase A24A prepilin type IV  33.88 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  29.38 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  29.53 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  33.56 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0657  prepilin peptidase transmembrane protein  33.33 
 
 		 172 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6385  normal  0.502412 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  34.01 
 
 		 167 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0512  peptidase A24A prepilin type IV  30.56 
 
 		 167 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000304579  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  33.12 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  33.87 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7226  peptidase A24A prepilin type IV  31.97 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.22284 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  33.05 
 
 		 175 aa  48.5  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  33.55 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  33.55 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  33.55 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  31.11 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2743  peptidase A24A prepilin type IV  37.57 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2358  hypothetical protein  35.71 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  30.52 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  32.48 
 
 		 287 aa  42.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  33.01 
 
 		 164 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5406  peptidase A24A, prepilin type IV  27.67 
 
 		 166 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  29.41 
 
 		 151 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  30.77 
 
 		 192 aa  42  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  35.51 
 
 		 283 aa  41.6  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1980  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 142 aa  41.2  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>