50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1491 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 187 aa  361  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  42.11 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  37.57 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2358  hypothetical protein  42.24 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2743  peptidase A24A prepilin type IV  40.7 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  35.22 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  35 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  37.29 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  32.02 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  34.24 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  34.5 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03359  prepilin peptidase CpaA  29.56 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0657  prepilin peptidase transmembrane protein  36.65 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6385  normal  0.502412 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  32.46 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  34.94 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  32.79 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7226  peptidase A24A prepilin type IV  39.6 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.22284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  35.62 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  31.03 
 
 		 178 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  28.04 
 
 		 191 aa  51.2  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  32.95 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2480  peptidase A24A prepilin type IV  34.23 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139077 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0545  prepilin peptidase CpaA  36.59 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  33.53 
 
 		 179 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  33.53 
 
 		 179 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  26.63 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  30.86 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  33.53 
 
 		 179 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  30.9 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  32.84 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  30.9 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1036  peptidase A24A prepilin type IV  35.71 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  24.64 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  35.33 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  32.46 
 
 		 260 aa  45.1  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1980  peptidase A24A prepilin type IV  37.37 
 
 		 142 aa  45.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175431  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  32.09 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2362  peptidase A24A, prepilin type IV  40.46 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4443  peptidase A24A prepilin type IV  31.06 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  29.41 
 
 		 164 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  32.02 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.09 
 
 		 288 aa  42.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0512  peptidase A24A prepilin type IV  28.16 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000304579  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  31.68 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  28.77 
 
 		 168 aa  42  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  31.39 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  31.62 
 
 		 255 aa  41.6  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  27.1 
 
 		 166 aa  41.2  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  32.14 
 
 		 300 aa  40.8  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>