54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2480 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2480  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 
177 aa  342  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139077 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  31.71 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  29.3 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  29.38 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  29.14 
 
 
179 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  29.14 
 
 
179 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  29.48 
 
 
179 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  28.07 
 
 
179 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  28.07 
 
 
179 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  28.07 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  27.67 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  33.04 
 
 
145 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  32.23 
 
 
274 aa  55.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  34.44 
 
 
192 aa  54.3  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  27.56 
 
 
178 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  31.4 
 
 
274 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  38.71 
 
 
255 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  25.84 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  26.96 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  31.61 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  34.23 
 
 
187 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  32.23 
 
 
259 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  30.11 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  29.41 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  29.55 
 
 
179 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  27.27 
 
 
188 aa  48.5  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  31.01 
 
 
291 aa  48.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  36.29 
 
 
260 aa  47.8  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0657  prepilin peptidase transmembrane protein  32.35 
 
 
172 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6385  normal  0.502412 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  29.01 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.37 
 
 
288 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  38.71 
 
 
167 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  27.27 
 
 
191 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.23 
 
 
259 aa  45.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  31.36 
 
 
263 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  30 
 
 
302 aa  44.3  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  30 
 
 
283 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0512  peptidase A24A prepilin type IV  26.72 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000304579  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  32 
 
 
283 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  34.23 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  34.23 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  28.18 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  35.42 
 
 
287 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  32.2 
 
 
261 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  38.96 
 
 
246 aa  42.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0545  prepilin peptidase CpaA  35.04 
 
 
142 aa  42.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  34.38 
 
 
287 aa  42  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  29.17 
 
 
258 aa  42  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  26.06 
 
 
178 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  26.96 
 
 
165 aa  42  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  32.67 
 
 
168 aa  41.2  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  29.46 
 
 
295 aa  40.8  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  30.7 
 
 
280 aa  41.2  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0184  peptidase A24B, FlaK-like protein  36.89 
 
 
234 aa  40.8  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.932953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>