80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7204 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 
180 aa  345  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  90 
 
 
179 aa  283  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  90 
 
 
179 aa  283  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  89.44 
 
 
179 aa  283  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  80.9 
 
 
179 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  80.9 
 
 
180 aa  248  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  62.78 
 
 
204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  61.67 
 
 
179 aa  197  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  62.78 
 
 
179 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  62.78 
 
 
179 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  49.71 
 
 
181 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  46.07 
 
 
167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  47.83 
 
 
179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  43.35 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  44.51 
 
 
178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  45.56 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  42.48 
 
 
192 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  41.92 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0657  prepilin peptidase transmembrane protein  46.91 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6385  normal  0.502412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  39.18 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  35.56 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  30.29 
 
 
183 aa  62.8  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  31.01 
 
 
191 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  38.1 
 
 
145 aa  61.2  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2362  peptidase A24A, prepilin type IV  43.18 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  39.62 
 
 
151 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  37.5 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  38.78 
 
 
166 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  38.78 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  38.78 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  38.78 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  38.78 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  38.78 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  38.78 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  38.78 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2480  peptidase A24A prepilin type IV  27.68 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139077 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  40.95 
 
 
164 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  40.59 
 
 
165 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  35.5 
 
 
187 aa  54.3  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  29.63 
 
 
218 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  39.53 
 
 
165 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  33.76 
 
 
166 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  34.9 
 
 
167 aa  51.2  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  39.6 
 
 
164 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  39.6 
 
 
164 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  39.6 
 
 
164 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2801  putative prepilin peptidase transmembrane protein, CpaA like  41.67 
 
 
166 aa  48.5  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  31.48 
 
 
183 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  28.69 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  27.04 
 
 
188 aa  45.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0545  prepilin peptidase CpaA  40.23 
 
 
142 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.35 
 
 
280 aa  45.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  33.63 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  33.63 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  36.59 
 
 
318 aa  45.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5406  peptidase A24A, prepilin type IV  32 
 
 
166 aa  45.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  30.86 
 
 
183 aa  45.1  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2074  peptidase A24A prepilin type IV  35.57 
 
 
189 aa  44.7  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2358  hypothetical protein  32.56 
 
 
185 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.01 
 
 
299 aa  43.9  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  30.77 
 
 
302 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2743  peptidase A24A prepilin type IV  35.63 
 
 
196 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3971  peptidase A24A prepilin type IV  34.38 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0388817  normal  0.704263 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  32.05 
 
 
185 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  33.61 
 
 
309 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  33.62 
 
 
283 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  30.65 
 
 
287 aa  42  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  30.83 
 
 
288 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1400  peptidase A24A, prepilin type IV  33.08 
 
 
166 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  23.89 
 
 
252 aa  42.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  33.33 
 
 
295 aa  41.6  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  33.61 
 
 
303 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  34.95 
 
 
168 aa  41.2  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3454  Prepilin peptidase  38.89 
 
 
306 aa  41.2  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110375  hitchhiker  0.0033362 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  33.05 
 
 
287 aa  40.8  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  32.79 
 
 
303 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  33.05 
 
 
287 aa  40.8  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  29.24 
 
 
255 aa  41.2  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2318  peptidase A24A prepilin type IV  37.93 
 
 
181 aa  40.8  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.20935 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  34.68 
 
 
296 aa  40.8  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>