45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2318 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2318  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 181 aa  347  7e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20935 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  35.88 
 
 		 183 aa  91.3  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  35.88 
 
 		 183 aa  91.3  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  45.45 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  37.13 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5406  peptidase A24A, prepilin type IV  37.79 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  35.26 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2074  peptidase A24A prepilin type IV  39.39 
 
 		 189 aa  72  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  33.13 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  36.02 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  37.42 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  37.42 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  37.42 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  43.81 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  43.81 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  43.81 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  43.81 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  43.81 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  43.81 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  43.81 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  43.93 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1400  peptidase A24A, prepilin type IV  36.42 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174968  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4443  peptidase A24A prepilin type IV  40.95 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2801  putative prepilin peptidase transmembrane protein, CpaA like  36.63 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  33.14 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  29.01 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  36.8 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0892  peptidase A24A domain protein  38.68 
 
 		 251 aa  47.8  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  31.58 
 
 		 248 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  29.1 
 
 		 240 aa  44.7  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  39.13 
 
 		 181 aa  44.7  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  37.62 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  33.04 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2480  peptidase A24A prepilin type IV  26.35 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139077 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  37 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  50 
 
 		 294 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  31.76 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  37 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0545  prepilin peptidase CpaA  46.43 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  27.06 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  37.88 
 
 		 275 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  33.67 
 
 		 183 aa  42  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  34.38 
 
 		 255 aa  41.6  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  33.33 
 
 		 260 aa  41.6  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  30.89 
 
 		 274 aa  41.2  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>