49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5406 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5406  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 166 aa  318  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  42.28 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  42.28 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  44.6 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2318  peptidase A24A prepilin type IV  38.73 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  31.61 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  32.45 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  32.45 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  32.45 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  32 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4443  peptidase A24A prepilin type IV  41.75 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2074  peptidase A24A prepilin type IV  38.96 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  29.37 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  31.33 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  34.51 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  37.33 
 
 		 194 aa  48.5  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  36.6 
 
 		 204 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  36.6 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  36.6 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  34.21 
 
 		 179 aa  47.4  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  33.96 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  33.96 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  33.96 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  33.96 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  33.96 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  33.33 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  32.8 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  33.96 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  33.96 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  31.21 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1400  peptidase A24A, prepilin type IV  30.26 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174968  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  32 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  34.44 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  32.69 
 
 		 179 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2801  putative prepilin peptidase transmembrane protein, CpaA like  37.35 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  30.86 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  43.02 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  29.75 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1980  peptidase A24A prepilin type IV  42.11 
 
 		 142 aa  42  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175431  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  33.64 
 
 		 178 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  32.05 
 
 		 179 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55800  hypothetical protein  26.62 
 
 		 160 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  29.61 
 
 		 181 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  32.05 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  29.17 
 
 		 189 aa  41.6  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  32.05 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  31.01 
 
 		 178 aa  40.8  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  29.91 
 
 		 168 aa  40.8  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  33.67 
 
 		 183 aa  40.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>