40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1650 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 166 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2801  putative prepilin peptidase transmembrane protein, CpaA like  83.73 
 
 		 166 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  55.03 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  54.49 
 
 		 165 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1400  peptidase A24A, prepilin type IV  56.08 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  52.26 
 
 		 164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  52.26 
 
 		 164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  52.26 
 
 		 164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  50.6 
 
 		 164 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  52.74 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  52.05 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  52.05 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  52.05 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  52.05 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  52.05 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  52.05 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  51.37 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4443  peptidase A24A prepilin type IV  40.74 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2074  peptidase A24A prepilin type IV  38.32 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  39.6 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2318  peptidase A24A prepilin type IV  37.13 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20935 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  32.03 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  32.03 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  35.92 
 
 		 145 aa  51.2  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  28.21 
 
 		 178 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  36.84 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  37.8 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  32.12 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  38.36 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  40.26 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5406  peptidase A24A, prepilin type IV  33.93 
 
 		 166 aa  44.3  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  30.06 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  33.33 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  30.06 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  39.29 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55800  hypothetical protein  34.62 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  34.55 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  27.1 
 
 		 187 aa  41.2  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  33.04 
 
 		 180 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0620  peptidase A24A prepilin type IV  32.64 
 
 		 156 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>