29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1400 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1400  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 166 aa  316  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  65.62 
 
 		 165 aa  198  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  61.88 
 
 		 165 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  58.02 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  58.02 
 
 		 164 aa  165  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  58.02 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  58.02 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  60.24 
 
 		 166 aa  153  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  61.45 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  60.84 
 
 		 166 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  60.84 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  60.84 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  60.84 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  60.84 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  60.84 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  56.08 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2801  putative prepilin peptidase transmembrane protein, CpaA like  54.05 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2074  peptidase A24A prepilin type IV  41.98 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4443  peptidase A24A prepilin type IV  37.72 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  37.06 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  32.89 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  32.89 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2318  peptidase A24A prepilin type IV  35.8 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20935 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  38.67 
 
 		 178 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  54.76 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  35.63 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0545  prepilin peptidase CpaA  34.85 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  39.19 
 
 		 192 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5406  peptidase A24A, prepilin type IV  32.17 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>