66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0790 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 192 aa  360  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  49.67 
 
 		 192 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  45.18 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  45.51 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  45.51 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  44.91 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  38.41 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  41.77 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  41.92 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  43.79 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  40.57 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  43.2 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  41.14 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  43.2 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  35.33 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  35.85 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  36.36 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  36.52 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  38.22 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  34.78 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  34.24 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  27.53 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0657  prepilin peptidase transmembrane protein  39.02 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6385  normal  0.502412 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  28.74 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  40.2 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  41.46 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  41.46 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  41.46 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  37.25 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  39.22 
 
 		 166 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  38.24 
 
 		 166 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  32.2 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2743  peptidase A24A prepilin type IV  41.67 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  38.24 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  38.24 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  38.24 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  38.24 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  38.24 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  37.8 
 
 		 166 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2362  peptidase A24A, prepilin type IV  48.31 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  35.29 
 
 		 166 aa  48.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2318  peptidase A24A prepilin type IV  33.71 
 
 		 181 aa  47.8  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20935 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  35.51 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  33.98 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.79 
 
 		 281 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2358  hypothetical protein  31.18 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 151 aa  44.7  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  33.15 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2801  putative prepilin peptidase transmembrane protein, CpaA like  35.37 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4443  peptidase A24A prepilin type IV  42.57 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1036  peptidase A24A prepilin type IV  33.53 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  27.61 
 
 		 255 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  32.37 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1400  peptidase A24A, prepilin type IV  35.63 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2074  peptidase A24A prepilin type IV  38.82 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  25.77 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  27.61 
 
 		 300 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03359  prepilin peptidase CpaA  26.97 
 
 		 147 aa  42  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  29.17 
 
 		 266 aa  42  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  29.17 
 
 		 266 aa  42  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  31.97 
 
 		 183 aa  41.6  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.77 
 
 		 259 aa  41.6  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  31.97 
 
 		 183 aa  41.6  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  33.71 
 
 		 246 aa  41.2  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  35.25 
 
 		 255 aa  41.2  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>