69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1517 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 194 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  36.63 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  36.53 
 
 		 178 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  42.07 
 
 		 192 aa  92  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  37.91 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  35.09 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  39.38 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  40 
 
 		 179 aa  85.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  40 
 
 		 179 aa  85.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  31.18 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  36.72 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  37.43 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  34.55 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  38.89 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  38.89 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  36.2 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  38.27 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  36.2 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  40.24 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  36.09 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  34.57 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  34.71 
 
 		 167 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  41.18 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  41.18 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  41.18 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0657  prepilin peptidase transmembrane protein  38.92 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6385  normal  0.502412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4443  peptidase A24A prepilin type IV  35.71 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  33.64 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  33.64 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  37.62 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  35.77 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2743  peptidase A24A prepilin type IV  32.95 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  34 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2801  putative prepilin peptidase transmembrane protein, CpaA like  42.53 
 
 		 166 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2358  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  34.29 
 
 		 168 aa  51.2  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  34.94 
 
 		 188 aa  51.2  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55800  hypothetical protein  32.95 
 
 		 160 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  27.98 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2362  peptidase A24A, prepilin type IV  36.57 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  35.85 
 
 		 167 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  34.48 
 
 		 166 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  36.84 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  33.62 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  33.62 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  33.62 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  38.2 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  33.62 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  33.62 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  33.62 
 
 		 166 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2074  peptidase A24A prepilin type IV  42.11 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4862  hypothetical protein  34.52 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0540679  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  33.65 
 
 		 165 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2480  peptidase A24A prepilin type IV  24.22 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139077 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  30.58 
 
 		 165 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  26.05 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2318  peptidase A24A prepilin type IV  33.04 
 
 		 181 aa  44.7  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  29.19 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0620  peptidase A24A prepilin type IV  30.77 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450509 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5406  peptidase A24A, prepilin type IV  36 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0545  prepilin peptidase CpaA  34.15 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0512  peptidase A24A prepilin type IV  27.59 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000304579  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0184  peptidase A24A, prepilin type IV  29.63 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0397814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  33.67 
 
 		 145 aa  42  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1036  peptidase A24A prepilin type IV  27.74 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7226  peptidase A24A prepilin type IV  34.19 
 
 		 187 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.22284 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0575  hypothetical protein  29.01 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0614  peptidase A24A, prepilin type IV  29.01 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0179326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1980  peptidase A24A prepilin type IV  31.4 
 
 		 142 aa  41.2  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>