58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A3082 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 204 aa  387  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  99.44 
 
 		 179 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  99.44 
 
 		 179 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  91.62 
 
 		 179 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  64.04 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  63.59 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  63.59 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  64.13 
 
 		 179 aa  184  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  63.37 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  62.78 
 
 		 180 aa  180  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  49.7 
 
 		 181 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  43.82 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  44.85 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  49.11 
 
 		 167 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  47.71 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  44.1 
 
 		 179 aa  104  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  42.94 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  44.91 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0657  prepilin peptidase transmembrane protein  49.38 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6385  normal  0.502412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  37.91 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  36.42 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  30.63 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2480  peptidase A24A prepilin type IV  29.38 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  42.11 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  30.95 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  31.45 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  39.73 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  35.85 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  39.73 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  39.73 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  39.73 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  39.73 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  39.73 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  39.73 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  28.57 
 
 		 175 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  40 
 
 		 164 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  39.73 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1036  peptidase A24A prepilin type IV  36.71 
 
 		 159 aa  48.9  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  40 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  40 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  40 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  36.46 
 
 		 165 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  30.21 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  38.16 
 
 		 165 aa  45.1  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2074  peptidase A24A prepilin type IV  41.3 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  35.98 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5406  peptidase A24A, prepilin type IV  33.77 
 
 		 166 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0512  peptidase A24A prepilin type IV  26.36 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000304579  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.32 
 
 		 299 aa  43.1  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  34.43 
 
 		 159 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2362  peptidase A24A, prepilin type IV  37.87 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  31.53 
 
 		 183 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  31.53 
 
 		 183 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  33.05 
 
 		 250 aa  42  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  29.63 
 
 		 188 aa  42  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  34.43 
 
 		 159 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2743  peptidase A24A prepilin type IV  36.84 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  32.9 
 
 		 174 aa  41.2  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>