85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2362 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2362  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 194 aa  362  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  43.48 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  43.58 
 
 		 179 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  43.58 
 
 		 179 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  44.13 
 
 		 179 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  43.75 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  43.6 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  39.46 
 
 		 178 aa  89  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  39.34 
 
 		 179 aa  88.2  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  40.56 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  38.8 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  40.21 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  40 
 
 		 187 aa  85.1  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  34.04 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  38.2 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  40.56 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  38.2 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  37.78 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  38.2 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  38.2 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  36.7 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  40.76 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  39.13 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  37.29 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  34.07 
 
 		 167 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  40.34 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  40.34 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  40.34 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  40.34 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  31.92 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  40.34 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  40.34 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  43 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  40.34 
 
 		 166 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  42.71 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0657  prepilin peptidase transmembrane protein  35.94 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6385  normal  0.502412 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  40.86 
 
 		 166 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2358  hypothetical protein  35.39 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  39.8 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  39.8 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  39.8 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2480  peptidase A24A prepilin type IV  28.65 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2801  putative prepilin peptidase transmembrane protein, CpaA like  42.42 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  38.26 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  35.96 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  37.23 
 
 		 255 aa  52.4  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2743  peptidase A24A prepilin type IV  43.24 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  40.82 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  33.93 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2318  peptidase A24A prepilin type IV  40.26 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1400  peptidase A24A, prepilin type IV  38.33 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  35.34 
 
 		 259 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  32.03 
 
 		 145 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  33.93 
 
 		 274 aa  48.5  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3146  peptidase A24A prepilin type IV  38.71 
 
 		 147 aa  48.5  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  38.61 
 
 		 168 aa  48.5  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1980  peptidase A24A prepilin type IV  40.26 
 
 		 142 aa  48.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175431  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  31.58 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5406  peptidase A24A, prepilin type IV  30.39 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0545  prepilin peptidase CpaA  36.11 
 
 		 142 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  30.33 
 
 		 263 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  33.64 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  33.63 
 
 		 258 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3033  peptidase A24A, prepilin type IV  35.96 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0604  peptidase A24A prepilin type IV  37.63 
 
 		 147 aa  45.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.447619  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1591  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.3 
 
 		 329 aa  45.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  33.96 
 
 		 250 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  28.07 
 
 		 247 aa  45.1  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.25 
 
 		 259 aa  45.1  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.75 
 
 		 281 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  26.47 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  27.19 
 
 		 247 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  33 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  33 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  32.82 
 
 		 265 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2074  peptidase A24A prepilin type IV  41.89 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3759  peptidase A24A, prepilin type IV  40.68 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal  0.405362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  31.25 
 
 		 259 aa  42.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  34.91 
 
 		 253 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  32.67 
 
 		 157 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4406  peptidase A24A prepilin type IV  34.19 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1484  peptidase A24A prepilin type IV  37.5 
 
 		 147 aa  42  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  32.46 
 
 		 254 aa  41.2  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7226  peptidase A24A prepilin type IV  34.65 
 
 		 187 aa  41.2  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.22284 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  43.68 
 
 		 247 aa  41.2  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>