32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3759 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3759  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 
147 aa  270  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal  0.405362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2644  peptidase A24A, prepilin type IV  68.06 
 
 
150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2350  peptidase A24A, prepilin type IV  61.48 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.747166  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2391  peptidase A24A, prepilin type IV  61.48 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.300874  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2397  peptidase A24A, prepilin type IV  61.48 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12572  hypothetical protein  56.2 
 
 
139 aa  104  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000763367  normal  0.175513 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1980  peptidase A24A prepilin type IV  45.74 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175431  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15430  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  38.64 
 
 
218 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5256  peptidase A24A prepilin type IV  39.34 
 
 
194 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.652465  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  36.57 
 
 
261 aa  50.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3428  peptidase A24A prepilin type IV  39.1 
 
 
223 aa  50.1  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  35.09 
 
 
246 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  40.4 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  36.22 
 
 
253 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  32.03 
 
 
287 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  40.24 
 
 
221 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0841  peptidase A24A prepilin type IV  37.21 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  38.83 
 
 
179 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  31.3 
 
 
183 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  31.3 
 
 
183 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  33.08 
 
 
165 aa  42.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4241  prepilin peptidase  30.71 
 
 
287 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  32.82 
 
 
220 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  29.66 
 
 
164 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  29.66 
 
 
164 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  29.66 
 
 
164 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  29.69 
 
 
259 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  31.75 
 
 
229 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  27.34 
 
 
255 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  35.88 
 
 
260 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  29.51 
 
 
253 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  30.37 
 
 
164 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>