31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15430 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_15430  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  100 
 
 		 218 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5256  peptidase A24A prepilin type IV  35.94 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.652465  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3759  peptidase A24A, prepilin type IV  40.48 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal  0.405362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2644  peptidase A24A, prepilin type IV  38.46 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  40.91 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  36 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  36.49 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2350  peptidase A24A, prepilin type IV  37.9 
 
 		 133 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.747166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2397  peptidase A24A, prepilin type IV  37.9 
 
 		 133 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2391  peptidase A24A, prepilin type IV  37.9 
 
 		 133 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.300874  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  31.41 
 
 		 275 aa  49.3  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  38.58 
 
 		 262 aa  49.3  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  38.3 
 
 		 324 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4462  peptidase A24A, prepilin type IV  37.3 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  40 
 
 		 167 aa  48.1  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  34.62 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1221  peptidase A24A domain-containing protein  31.25 
 
 		 249 aa  45.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.544367  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  31.25 
 
 		 259 aa  45.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3987  late competence protein comC  26.67 
 
 		 240 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1219  late competence protein comC  30.86 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1395  late competence protein comC  30.86 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1318  late competence protein comC  30.86 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1199  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  28.4 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1459  late competence protein comC  31.25 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  24.11 
 
 		 263 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  34.29 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1419  late competence protein comC  30 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  31.69 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  35.92 
 
 		 296 aa  42.7  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1197  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  30.86 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12572  hypothetical protein  35.66 
 
 		 139 aa  41.6  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000763367  normal  0.175513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>