145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4462 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4462  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 249 aa  455  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4975  peptidase A24A prepilin type IV  85.17 
 
 		 253 aa  284  9e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  38.91 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  37.45 
 
 		 242 aa  85.1  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  42.86 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  33.33 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  35.41 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  44.37 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  25.91 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.6 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  31.6 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  32.27 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  30.66 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  45.45 
 
 		 202 aa  62  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  41.13 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  24.77 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2122  peptidase A24A domain-containing protein  34.26 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.711302  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  30.19 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  31.88 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  30.85 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  31.73 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.72 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  28.92 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  32.23 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  29.21 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  33.5 
 
 		 288 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  35.71 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  30.36 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  30.45 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  35.71 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  27.75 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  27.44 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  33.5 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  28.02 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  32.2 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.83 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  31.73 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  34.91 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  32.2 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  27.16 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  27.59 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  33.01 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  28.71 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.81 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3012  peptidase A24A, prepilin type IV  38.24 
 
 		 170 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  34.98 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  29 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  35.96 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  43.48 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0963  type IV prepilin peptidase  28.18 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  38.76 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3259  prepilin peptidase  28.18 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000482568  hitchhiker  0.0000000000000925794 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1014  prepilin peptidase  28.18 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15430  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  36.84 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  37.76 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  35.47 
 
 		 289 aa  53.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.81 
 
 		 287 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3682  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.95 
 
 		 295 aa  53.1  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2827  type 4 prepilin peptidase bifunctionnal: leader peptidase and N-methyltransferase transmembrane protein  30.99 
 
 		 294 aa  52.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00920454  normal  0.142968 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.03 
 
 		 293 aa  52.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  27.16 
 
 		 308 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  34.76 
 
 		 186 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  28.57 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  32.38 
 
 		 303 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  23.96 
 
 		 264 aa  52.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.1 
 
 		 283 aa  52.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.8 
 
 		 259 aa  52  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  34.62 
 
 		 221 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  31.86 
 
 		 283 aa  52  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  30.1 
 
 		 258 aa  52.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.18 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  29.52 
 
 		 300 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  32.86 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  34.53 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  33.09 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0892  peptidase A24A domain protein  29.57 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  31.6 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  28.97 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  37.41 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  28.84 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  28.97 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  27.48 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  30.69 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0244  peptidase A24A domain protein  21.57 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.23 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  26.54 
 
 		 289 aa  49.7  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  26.96 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  29.38 
 
 		 318 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  34.43 
 
 		 309 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  28.77 
 
 		 291 aa  48.9  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  26.07 
 
 		 289 aa  48.9  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4241  prepilin peptidase  30.41 
 
 		 287 aa  48.9  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  28.64 
 
 		 288 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.26 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0427  peptidase A24A domain protein  34.86 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.47 
 
 		 309 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  34.29 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3072  Prepilin peptidase  32.03 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.373458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  37.4 
 
 		 303 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  37.4 
 
 		 303 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>