136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0501 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 202 aa  365  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  46.31 
 
 		 218 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  39.72 
 
 		 274 aa  90.1  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  45.04 
 
 		 261 aa  85.5  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  50 
 
 		 254 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  46.1 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  50 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  44.52 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  39.74 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  45.74 
 
 		 263 aa  74.7  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  41.43 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  34.27 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  36.36 
 
 		 229 aa  72  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  41.26 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  38.82 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  41.43 
 
 		 268 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  43.75 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  43.97 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  40.41 
 
 		 324 aa  64.7  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  41.03 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4462  peptidase A24A, prepilin type IV  46.34 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  44.07 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  44.35 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  31.75 
 
 		 255 aa  62  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  41.04 
 
 		 242 aa  62  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3428  peptidase A24A prepilin type IV  45.7 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  29.3 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  32.28 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  31.51 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0538  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  40.96 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  30.2 
 
 		 300 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  23.46 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.65 
 
 		 288 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  29.71 
 
 		 290 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  29.85 
 
 		 274 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.37 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  26.71 
 
 		 308 aa  52.8  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 166 aa  53.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  30.49 
 
 		 283 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  30.41 
 
 		 250 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  29.1 
 
 		 274 aa  52.4  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  25.34 
 
 		 304 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  35.77 
 
 		 248 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  25.34 
 
 		 308 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  27.87 
 
 		 303 aa  51.6  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  25.34 
 
 		 308 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.78 
 
 		 283 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  27.81 
 
 		 303 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  30.88 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.77 
 
 		 308 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  27.61 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  30.82 
 
 		 289 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1480  Prepilin peptidase  32.09 
 
 		 283 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2211  peptidase A24A prepilin type IV  41.1 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144961  normal  0.829698 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  29.69 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3154  peptidase A24A prepilin type IV  42.14 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  33.09 
 
 		 309 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  33.56 
 
 		 293 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  30.71 
 
 		 295 aa  49.7  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1037  peptidase A24A domain protein  35.53 
 
 		 267 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.869777 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.03 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  24.84 
 
 		 304 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0423  prepilin peptidase  27.98 
 
 		 303 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3072  Prepilin peptidase  34.46 
 
 		 293 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.373458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  31.54 
 
 		 264 aa  48.9  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1335  peptidase A24A, prepilin type IV  25.3 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.936907  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  30.66 
 
 		 260 aa  48.5  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4158  peptidase A24A prepilin type IV  41.04 
 
 		 225 aa  48.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.904391 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0510  peptidase A24A prepilin type IV  24.03 
 
 		 182 aa  48.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0178991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  27.74 
 
 		 259 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  36.31 
 
 		 254 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  31.72 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  33.85 
 
 		 288 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  28.69 
 
 		 305 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.58 
 
 		 265 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0304  prepilin peptidase  35.38 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.194253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  32.81 
 
 		 288 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  28.08 
 
 		 308 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4026  peptidase A24A prepilin type IV  39.84 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.369556  hitchhiker  0.00138175 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  28.48 
 
 		 302 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  29.85 
 
 		 291 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  33.54 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  33.54 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4222  Prepilin peptidase  36.49 
 
 		 321 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  28.57 
 
 		 289 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2827  type 4 prepilin peptidase bifunctionnal: leader peptidase and N-methyltransferase transmembrane protein  32.88 
 
 		 294 aa  45.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00920454  normal  0.142968 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4975  peptidase A24A prepilin type IV  46.34 
 
 		 253 aa  45.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  27.69 
 
 		 246 aa  45.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  28.57 
 
 		 288 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  34.46 
 
 		 318 aa  45.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.94 
 
 		 280 aa  45.1  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  26.57 
 
 		 289 aa  45.1  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  32.78 
 
 		 294 aa  44.7  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  33.69 
 
 		 280 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  31.65 
 
 		 289 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  35.97 
 
 		 294 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  33.85 
 
 		 288 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0244  peptidase A24A domain protein  22.62 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2122  peptidase A24A domain-containing protein  33.71 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.711302  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.08 
 
 		 308 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>