116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1248 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 186 aa  346  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  88.11 
 
 		 186 aa  287  7e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  51.28 
 
 		 275 aa  99  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  41.4 
 
 		 274 aa  99  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  45.86 
 
 		 217 aa  97.1  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  42.59 
 
 		 268 aa  95.5  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  42.76 
 
 		 261 aa  92.8  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  66.22 
 
 		 263 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  38.04 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  58.02 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  39.51 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  34.27 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  37.66 
 
 		 242 aa  70.9  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  31.33 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3428  peptidase A24A prepilin type IV  46.81 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  43.79 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  40 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  40.56 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  33.95 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  34.78 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  40.86 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  33.54 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  30.34 
 
 		 254 aa  57.8  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  34.75 
 
 		 288 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  30.51 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  31.14 
 
 		 253 aa  57  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1419  late competence protein comC  28.29 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  29.19 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  35.46 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  28.97 
 
 		 274 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  29.73 
 
 		 300 aa  55.1  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  30.86 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1199  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  26.92 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  30.3 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  30.61 
 
 		 274 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1459  late competence protein comC  28.29 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1197  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  27.63 
 
 		 240 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  46.38 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  38.3 
 
 		 280 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  28.57 
 
 		 295 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  30.54 
 
 		 253 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1219  late competence protein comC  26.97 
 
 		 240 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1318  late competence protein comC  26.97 
 
 		 240 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1395  late competence protein comC  26.97 
 
 		 240 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.5 
 
 		 308 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.72 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.36 
 
 		 288 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1221  peptidase A24A domain-containing protein  26.97 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.544367  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1136  peptidase A24A domain-containing protein  51.43 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  32.58 
 
 		 240 aa  49.7  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  36.57 
 
 		 266 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  36.57 
 
 		 266 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  33.33 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.63 
 
 		 259 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  29.29 
 
 		 263 aa  48.9  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  29.05 
 
 		 289 aa  48.9  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  31.21 
 
 		 288 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4026  peptidase A24A prepilin type IV  38.17 
 
 		 223 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.369556  hitchhiker  0.00138175 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  31.85 
 
 		 308 aa  48.1  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  46.48 
 
 		 248 aa  47.8  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  33.33 
 
 		 318 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.5 
 
 		 309 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  31.94 
 
 		 291 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  29.52 
 
 		 304 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  33.33 
 
 		 308 aa  47.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  33.33 
 
 		 264 aa  47.4  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3987  late competence protein comC  25.33 
 
 		 240 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.5 
 
 		 308 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  30.07 
 
 		 288 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4646  peptidase, A24 (type IV prepilin peptidase) family  32.93 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000049764  normal  0.0336249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5256  peptidase A24A prepilin type IV  32.64 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.652465  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  26.32 
 
 		 289 aa  45.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  29.52 
 
 		 308 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  29.52 
 
 		 308 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1357  late competence protein comC  25.83 
 
 		 240 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4158  peptidase A24A prepilin type IV  37.5 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.904391 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0731  peptidase A24A, prepilin type IV  35.1 
 
 		 159 aa  45.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.465055  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  33.78 
 
 		 254 aa  45.4  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  29.3 
 
 		 305 aa  45.1  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  30.46 
 
 		 166 aa  45.1  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  43.08 
 
 		 260 aa  45.1  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  29.94 
 
 		 259 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.61 
 
 		 303 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1154  peptidase A24A-like protein  34.9 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0421152  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  29.49 
 
 		 308 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.43 
 
 		 265 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1335  peptidase A24A, prepilin type IV  40.98 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.936907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  28.92 
 
 		 304 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  42.39 
 
 		 303 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3618  A24 family peptidase  32.34 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960523  hitchhiker  0.00521455 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  30.34 
 
 		 258 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1186  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  40.32 
 
 		 282 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262365  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  31.61 
 
 		 303 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  31.61 
 
 		 303 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.5 
 
 		 281 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  27.63 
 
 		 291 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  31.69 
 
 		 286 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3806  A24 family peptidase  31.74 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000259026  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0423  prepilin peptidase  32.22 
 
 		 303 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  29.79 
 
 		 303 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>