141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5009 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 280 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  85.38 
 
 		 255 aa  325  5e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  41.45 
 
 		 221 aa  89  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  34.27 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  42.13 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  40.65 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  33.81 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  42.75 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  39.46 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  35.68 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.88 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  26.92 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  29.82 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  31.22 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  26.13 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  26.13 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  25.63 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  29.95 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  27.36 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  25.13 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.63 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  39.57 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  38.71 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  35.03 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  26.83 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2090  peptidase A24A domain protein  26.73 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  29.41 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  26.47 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  28.77 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  33.01 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  26.85 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3428  peptidase A24A prepilin type IV  41.52 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.5 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  39.41 
 
 		 202 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  28.77 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  30.23 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  27.96 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  24.14 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  25 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0367  prepilin peptidase  27.83 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0600095  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  48.44 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  27.18 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0423  prepilin peptidase  25.96 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  25.98 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4241  prepilin peptidase  30.63 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.04 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  27.27 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  26.11 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  25.62 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2579  peptidase A24A domain protein  24.31 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.691194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4462  peptidase A24A, prepilin type IV  39.39 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  28.78 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  28.78 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  34.44 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  25.32 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  27.14 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  37.01 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  29.9 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.18 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  23.5 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  28.88 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  27.73 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  21.6 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  26.87 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  25.11 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  35.15 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  26.94 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  27.44 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  25.11 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  31.92 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  27.2 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3440  prepilin peptidase  23.56 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.823823  normal  0.0376305 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  25.62 
 
 		 305 aa  52.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5164  type 4 prepilin peptidase PilD  29.61 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  32.9 
 
 		 303 aa  52.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2962  prepilin peptidase  29.41 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  26.46 
 
 		 264 aa  52.4  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1422  Prepilin peptidase  27.85 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  25.86 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  36.24 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0773  prepilin peptidase  25.37 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3012  peptidase A24A, prepilin type IV  35.56 
 
 		 170 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  29.07 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  25.45 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  23.04 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  33.33 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.44 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  28.92 
 
 		 290 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  26.84 
 
 		 297 aa  49.3  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  34.42 
 
 		 186 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  31.03 
 
 		 242 aa  48.9  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  28.79 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  30.52 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  23.08 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0637  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.96 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000248086  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  23.81 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  25 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  33.57 
 
 		 166 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3072  Prepilin peptidase  27.17 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.373458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>