103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07790 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  100 
 
 		 253 aa  476  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  41.6 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  36.92 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  40.48 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  42.62 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  37.5 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  44.35 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4462  peptidase A24A, prepilin type IV  44.17 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  43.08 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  42.86 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3428  peptidase A24A prepilin type IV  46.77 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  30.94 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  38.28 
 
 		 275 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  36.09 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  39.23 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  43.06 
 
 		 202 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  39.84 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  39.74 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4975  peptidase A24A prepilin type IV  42.5 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  36 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  33.14 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  39.2 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  32.56 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  35.11 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  32.8 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  31.78 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  32.56 
 
 		 303 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  31.78 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.33 
 
 		 308 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  31.54 
 
 		 308 aa  53.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  30.67 
 
 		 295 aa  53.1  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0538  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  33.33 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  31.58 
 
 		 303 aa  52.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  31.01 
 
 		 304 aa  52  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  37.04 
 
 		 283 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  31.65 
 
 		 186 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  35.42 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.07 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  32.31 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  33.78 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  29.32 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  30 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  41.33 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  32.85 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  33.59 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3440  prepilin peptidase  31.58 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.823823  normal  0.0376305 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.93 
 
 		 288 aa  49.3  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  34.11 
 
 		 308 aa  48.9  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0367  prepilin peptidase  33.83 
 
 		 304 aa  48.9  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0600095  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.85 
 
 		 303 aa  48.5  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  35.61 
 
 		 288 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  32.59 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  30.23 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  32.59 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  35.29 
 
 		 296 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  30.83 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  32.59 
 
 		 303 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  34.06 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  35.66 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.11 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  32.59 
 
 		 303 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.11 
 
 		 309 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  31.88 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1335  peptidase A24A, prepilin type IV  29.03 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.936907  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  34.07 
 
 		 303 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  34.85 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.14 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3012  peptidase A24A, prepilin type IV  36.36 
 
 		 170 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.81 
 
 		 293 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3759  peptidase A24A, prepilin type IV  35.77 
 
 		 147 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal  0.405362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  35.61 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  32.59 
 
 		 303 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  30.83 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2644  peptidase A24A, prepilin type IV  34.33 
 
 		 150 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1136  peptidase A24A domain-containing protein  39.68 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  32.09 
 
 		 294 aa  46.2  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  30.88 
 
 		 287 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3404  peptidase A24A prepilin type IV  41.94 
 
 		 212 aa  46.2  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.34 
 
 		 293 aa  45.4  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  31.34 
 
 		 293 aa  45.4  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  30.88 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  28.67 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  31.62 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  31.62 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  30.23 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  31.62 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  29.41 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  32.03 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.54 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  32.58 
 
 		 288 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  27.48 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  28.57 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0423  prepilin peptidase  32.56 
 
 		 303 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  27.59 
 
 		 166 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3454  Prepilin peptidase  35.11 
 
 		 306 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110375  hitchhiker  0.0033362 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  36.76 
 
 		 297 aa  43.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2122  peptidase A24A domain-containing protein  32.59 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.711302  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4646  peptidase, A24 (type IV prepilin peptidase) family  33.9 
 
 		 155 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000049764  normal  0.0336249 
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  28.46 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  34.31 
 
 		 296 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>