185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4495 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  461  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  85.38 
 
 
280 aa  318  5e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  36.76 
 
 
275 aa  90.1  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  36.57 
 
 
221 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  43.85 
 
 
253 aa  82  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  35.68 
 
 
242 aa  82  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  28.64 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  28.64 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  37.34 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  44.22 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  27.96 
 
 
304 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  27.49 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  28.64 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  40.26 
 
 
260 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  28.64 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.27 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  27.43 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.14 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  30.95 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  42.66 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  40 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.64 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4241  prepilin peptidase  34.72 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  31.1 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  25.32 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.03 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  27.59 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  28.08 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.14 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  26.29 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4462  peptidase A24A, prepilin type IV  44 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  42.86 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3428  peptidase A24A prepilin type IV  42.86 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  40.32 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0423  prepilin peptidase  28.14 
 
 
303 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  32.04 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  25.98 
 
 
300 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  29.49 
 
 
291 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  26.63 
 
 
303 aa  64.7  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  27.75 
 
 
294 aa  63.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  27.72 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0367  prepilin peptidase  27.14 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0600095  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  30.77 
 
 
288 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  38.62 
 
 
324 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  27.73 
 
 
287 aa  62.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  29.6 
 
 
264 aa  62.4  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2579  peptidase A24A domain protein  27.06 
 
 
239 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.691194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  26.13 
 
 
308 aa  62.4  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  30.05 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  27.73 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  29.58 
 
 
281 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  29.46 
 
 
283 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.59 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  31.51 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3440  prepilin peptidase  25.13 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.823823  normal  0.0376305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  50 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  25.25 
 
 
289 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  29.2 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1422  Prepilin peptidase  30.67 
 
 
282 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  29.29 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  25.37 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  28.02 
 
 
287 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  42.86 
 
 
218 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  23.7 
 
 
254 aa  60.1  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  34.74 
 
 
262 aa  60.1  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  26.54 
 
 
295 aa  59.7  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  28.57 
 
 
291 aa  59.7  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.52 
 
 
293 aa  59.3  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  31.78 
 
 
248 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  26.85 
 
 
248 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  37.25 
 
 
186 aa  58.9  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  34.25 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  29.82 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2090  peptidase A24A domain protein  24.77 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0773  prepilin peptidase  27.09 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  29.82 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  23.7 
 
 
301 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  28.83 
 
 
309 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  26.91 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  28.87 
 
 
288 aa  56.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  26 
 
 
305 aa  56.2  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  24.81 
 
 
259 aa  55.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  25.11 
 
 
290 aa  55.8  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  40.74 
 
 
268 aa  55.8  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  37.66 
 
 
186 aa  55.5  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  23.53 
 
 
269 aa  55.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  31.53 
 
 
318 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  24.02 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  30.14 
 
 
303 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  30.52 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  27.73 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  28.92 
 
 
290 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  23.48 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1037  peptidase A24A domain protein  26.44 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.869777 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  26.39 
 
 
286 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  26.73 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5164  type 4 prepilin peptidase PilD  28.92 
 
 
290 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  29.36 
 
 
296 aa  53.1  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  23.92 
 
 
240 aa  52.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>