80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3210 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 218 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  53.3 
 
 		 220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  45.45 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  44.22 
 
 		 260 aa  95.1  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  42.95 
 
 		 275 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  46.31 
 
 		 202 aa  85.9  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  39.53 
 
 		 324 aa  84.7  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  44.62 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  41.61 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  43.2 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  39.86 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  43.55 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  46.38 
 
 		 262 aa  72  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  34.25 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  40.61 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  39.13 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  37.91 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  40 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  31.76 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  42.31 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  36.76 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  35.37 
 
 		 300 aa  61.6  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4026  peptidase A24A prepilin type IV  45.88 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.369556  hitchhiker  0.00138175 
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  31.69 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3428  peptidase A24A prepilin type IV  44.12 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  39.51 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3139  peptidase A24A prepilin type IV  45.6 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  33.55 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  38.76 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.26 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5256  peptidase A24A prepilin type IV  39.64 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.652465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  41.67 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  31.88 
 
 		 250 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4462  peptidase A24A, prepilin type IV  38.71 
 
 		 249 aa  52  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  31.51 
 
 		 166 aa  51.6  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  35.71 
 
 		 167 aa  51.6  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  31.16 
 
 		 302 aa  50.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4158  peptidase A24A prepilin type IV  37.24 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.904391 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2211  peptidase A24A prepilin type IV  38.19 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144961  normal  0.829698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  28.12 
 
 		 304 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  26.6 
 
 		 308 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  26.48 
 
 		 308 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4652  hypothetical protein  38.35 
 
 		 286 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.879908  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  31.03 
 
 		 283 aa  46.2  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  26 
 
 		 304 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  27.44 
 
 		 259 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  34.25 
 
 		 266 aa  45.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  34.25 
 
 		 266 aa  45.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  34.09 
 
 		 303 aa  45.4  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.48 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  27.54 
 
 		 308 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0538  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  38.36 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  31.34 
 
 		 288 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0510  peptidase A24A prepilin type IV  23.03 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0178991  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.86 
 
 		 288 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1561  peptidase A24A domain protein  34.04 
 
 		 261 aa  43.5  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  30.26 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  29.61 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  31.88 
 
 		 293 aa  43.5  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.88 
 
 		 293 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  26.21 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2754  peptidase A24A prepilin type IV  30.89 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000857279  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15430  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  34.01 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1480  Prepilin peptidase  31.78 
 
 		 283 aa  42.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  36.15 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1136  peptidase A24A domain-containing protein  50 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  36.15 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  26.21 
 
 		 274 aa  42.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  40.79 
 
 		 289 aa  42  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  33.09 
 
 		 303 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  29.23 
 
 		 283 aa  42  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  32.59 
 
 		 318 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  30 
 
 		 248 aa  42  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  25.19 
 
 		 303 aa  42  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  33.09 
 
 		 303 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  31.82 
 
 		 303 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.37 
 
 		 283 aa  41.6  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  33.81 
 
 		 254 aa  41.6  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  33.09 
 
 		 303 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  33.09 
 
 		 303 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>