82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4652 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4652  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  533  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.879908  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  35.57 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  37.93 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  40.48 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  50 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  33.55 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  32.62 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  35.34 
 
 		 220 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  31.33 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  42.11 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1136  peptidase A24A domain-containing protein  38.19 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  38.96 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  33.07 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  36.36 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  31.94 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  30.71 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  37.59 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  30.71 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  37.21 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  32.98 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  37.16 
 
 		 324 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  45.07 
 
 		 202 aa  52.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  40 
 
 		 255 aa  52.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  37.78 
 
 		 248 aa  52.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  28.65 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  36.36 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  33.91 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  46.27 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  33.91 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  33.82 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  31.3 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1719  hypothetical protein  36.14 
 
 		 221 aa  50.4  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135508  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  40 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  31.91 
 
 		 186 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  33.14 
 
 		 296 aa  49.7  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  36.36 
 
 		 296 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  32.65 
 
 		 275 aa  49.7  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2122  peptidase A24A domain-containing protein  33.94 
 
 		 255 aa  49.3  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.711302  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  29.68 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  27.32 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  47.06 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.64 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  26.67 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  33.82 
 
 		 167 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  32.75 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  47.95 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  30.56 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  25.95 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  32.38 
 
 		 240 aa  46.2  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1419  late competence protein comC  26.19 
 
 		 240 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30 
 
 		 265 aa  46.2  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1459  late competence protein comC  31.11 
 
 		 240 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  30.94 
 
 		 288 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  26.84 
 
 		 291 aa  45.8  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  29.94 
 
 		 186 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  37.84 
 
 		 250 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.31 
 
 		 283 aa  45.8  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0538  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  32.35 
 
 		 250 aa  45.8  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  25.93 
 
 		 308 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  25.93 
 
 		 308 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  27.52 
 
 		 166 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  36.36 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  34.34 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  26.12 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4462  peptidase A24A, prepilin type IV  36 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  34.34 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.53 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  32.04 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.12 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1221  peptidase A24A domain-containing protein  27.78 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.544367  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3012  peptidase A24A, prepilin type IV  32.67 
 
 		 170 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.13 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  25.96 
 
 		 305 aa  42.7  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  26.32 
 
 		 289 aa  43.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.32 
 
 		 280 aa  42.7  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  35.71 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  26.67 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  29.53 
 
 		 266 aa  42.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0892  peptidase A24A domain protein  35.16 
 
 		 251 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.93 
 
 		 308 aa  42.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  29.53 
 
 		 266 aa  42.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37 
 
 		 290 aa  42.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>