18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1719 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1719  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  392  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  28.89 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  33.33 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  32.84 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  33.04 
 
 		 300 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  33.81 
 
 		 268 aa  45.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0992  peptidase A24A domain-containing protein  26.25 
 
 		 240 aa  45.8  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0044171  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1138  peptidase A24A domain-containing protein  27.39 
 
 		 240 aa  45.1  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120004  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0773  prepilin peptidase  30.68 
 
 		 289 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0892  peptidase A24A domain protein  30.67 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  35.79 
 
 		 259 aa  42.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  33.33 
 
 		 324 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  27.21 
 
 		 166 aa  42  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  36.36 
 
 		 248 aa  41.6  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  31.79 
 
 		 266 aa  41.6  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  31.79 
 
 		 266 aa  41.6  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  33.33 
 
 		 255 aa  41.6  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>