172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0875 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  100 
 
 
324 aa  620  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  38.16 
 
 
274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  40.16 
 
 
275 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  44.13 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  43.42 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  37.16 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  28.02 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  29.89 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  28.51 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  43.54 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  28.94 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  27.16 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  42.86 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.08 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  26.05 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  30.84 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  27.31 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  27.68 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  28.9 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  24.92 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  25.75 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  30.08 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  31.17 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.62 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  40.56 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  25.91 
 
 
288 aa  67  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  28.24 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  25 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  29.44 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.35 
 
 
280 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  26.04 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  26.29 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  28.39 
 
 
250 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  38.64 
 
 
217 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2827  type 4 prepilin peptidase bifunctionnal: leader peptidase and N-methyltransferase transmembrane protein  27.45 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00920454  normal  0.142968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.24 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  28.35 
 
 
291 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  27.35 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  26.91 
 
 
288 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  23.48 
 
 
295 aa  63.9  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.61 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  36.92 
 
 
254 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  25 
 
 
305 aa  63.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  27.47 
 
 
240 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  39.33 
 
 
253 aa  62.8  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  25.54 
 
 
301 aa  62.8  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  36.73 
 
 
261 aa  62.8  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  24.36 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2579  peptidase A24A domain protein  30.8 
 
 
239 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.691194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  25.28 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.62 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  37.16 
 
 
262 aa  61.6  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  26.72 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  26.18 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  28.75 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  26.81 
 
 
288 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  29.89 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  25.38 
 
 
308 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  24.4 
 
 
290 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4158  peptidase A24A prepilin type IV  39.22 
 
 
225 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.904391 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.68 
 
 
303 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  25.81 
 
 
263 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.72 
 
 
293 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  24.9 
 
 
264 aa  60.1  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  29 
 
 
288 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  25.71 
 
 
289 aa  60.1  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  25.31 
 
 
289 aa  59.7  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.24 
 
 
308 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  24.79 
 
 
290 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0892  peptidase A24A domain protein  31.91 
 
 
251 aa  59.3  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  24.91 
 
 
290 aa  59.3  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.92 
 
 
269 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  29.33 
 
 
248 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  26.49 
 
 
288 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  23.38 
 
 
252 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  26.09 
 
 
259 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  27.98 
 
 
259 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  25.9 
 
 
274 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1422  Prepilin peptidase  26.62 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  34.18 
 
 
186 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  27.83 
 
 
281 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  27.31 
 
 
254 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  29.41 
 
 
296 aa  57.4  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3987  late competence protein comC  26.36 
 
 
240 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3072  Prepilin peptidase  26.27 
 
 
293 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.373458  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  26.27 
 
 
293 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  32.76 
 
 
254 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  27.19 
 
 
302 aa  56.2  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2962  prepilin peptidase  27.41 
 
 
295 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  26.1 
 
 
280 aa  55.8  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  28.3 
 
 
303 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  28.3 
 
 
303 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  33.55 
 
 
186 aa  55.8  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06881  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  21.54 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  25.56 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.51 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27 
 
 
283 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  25.81 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1357  late competence protein comC  26.96 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  27.51 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>