178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2919 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 229 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  45.32 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3428  peptidase A24A prepilin type IV  49.7 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  39.29 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  40.45 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  36.26 
 
 		 274 aa  89.7  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  37.22 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  35.96 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  39.43 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  41.45 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  34.84 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  36.94 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  37.5 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  35.36 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  36.42 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  36.9 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  33.11 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  31.67 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.91 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.72 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  32.45 
 
 		 248 aa  72  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  31.87 
 
 		 263 aa  72  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  33.51 
 
 		 295 aa  72  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  36.36 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  35.71 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  34.71 
 
 		 283 aa  68.6  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  29.83 
 
 		 308 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  33.91 
 
 		 283 aa  68.6  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  29.83 
 
 		 308 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  32.5 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  39.84 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  31.07 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.34 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  29.28 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  31.36 
 
 		 287 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  36.63 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  34.86 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  32.96 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  28.99 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  33.52 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.52 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  35.19 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  29.28 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  31.1 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.43 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1136  peptidase A24A domain-containing protein  36.31 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  29.38 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  33.14 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  29.67 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  27.89 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  34.23 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  30.77 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  37.65 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  33.14 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  29.25 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  30.18 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.68 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  35.59 
 
 		 289 aa  62  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  30.64 
 
 		 287 aa  62  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.89 
 
 		 308 aa  62  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  36.67 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  28.57 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  28.57 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  32.91 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  29.11 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  34.93 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  35.26 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  29.27 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.59 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  34.62 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  29.27 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  35.53 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5164  type 4 prepilin peptidase PilD  34.78 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  36.3 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  33.13 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  34.78 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  31.98 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0367  prepilin peptidase  32.94 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0600095  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  31.43 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  29.24 
 
 		 300 aa  58.5  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1154  peptidase A24A-like protein  38.32 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0421152  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.84 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  32.1 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  29.07 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  32.96 
 
 		 290 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  33.75 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  31.87 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  29.34 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  40.14 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  35.29 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  33.74 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  35.29 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  30.07 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  32.96 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  35.29 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5256  peptidase A24A prepilin type IV  36.88 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.652465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  32.18 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  32.07 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  33.54 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  33.54 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>