56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2632 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 221 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  44.62 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3428  peptidase A24A prepilin type IV  46.67 
 
 		 223 aa  86.3  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  36.22 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  36.53 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  35.54 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  30.94 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  36.07 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  34.29 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  39.16 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  31.65 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  38.46 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  32.9 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  37.72 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  35.22 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  34.94 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  39.32 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.53 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  35.97 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  33.1 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  32.47 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  35.62 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  34.27 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  42.19 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5256  peptidase A24A prepilin type IV  35.03 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.652465  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  33.33 
 
 		 289 aa  52.8  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  25.77 
 
 		 281 aa  52.4  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  30.73 
 
 		 295 aa  52  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3759  peptidase A24A, prepilin type IV  36.51 
 
 		 147 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal  0.405362 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  26.39 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  41.03 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4026  peptidase A24A prepilin type IV  36.75 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.369556  hitchhiker  0.00138175 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  31.6 
 
 		 324 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  33.33 
 
 		 289 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  30.32 
 
 		 293 aa  48.9  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.32 
 
 		 293 aa  48.5  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  27.88 
 
 		 300 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  29.63 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.49 
 
 		 269 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  30.57 
 
 		 304 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  30.15 
 
 		 291 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  28.82 
 
 		 308 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  29.17 
 
 		 308 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1335  peptidase A24A, prepilin type IV  32.03 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.936907  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  31.46 
 
 		 247 aa  45.4  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  30.81 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  31.46 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  28.57 
 
 		 304 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4462  peptidase A24A, prepilin type IV  34.65 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.17 
 
 		 308 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  33.98 
 
 		 288 aa  43.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  29.87 
 
 		 308 aa  42.4  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2754  peptidase A24A prepilin type IV  30.67 
 
 		 239 aa  42.4  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000857279  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3404  peptidase A24A prepilin type IV  32.99 
 
 		 212 aa  42  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  32.53 
 
 		 308 aa  42  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3454  Prepilin peptidase  34 
 
 		 306 aa  41.6  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110375  hitchhiker  0.0033362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>