191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6538 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  100 
 
 
254 aa  471  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  38.87 
 
 
274 aa  142  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  38.58 
 
 
261 aa  106  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  36.9 
 
 
275 aa  106  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4462  peptidase A24A, prepilin type IV  41.48 
 
 
249 aa  99.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  47.69 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  40.65 
 
 
262 aa  95.5  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  37.7 
 
 
242 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.08 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  48.82 
 
 
217 aa  88.6  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  42.33 
 
 
253 aa  88.6  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4975  peptidase A24A prepilin type IV  38.43 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  43.59 
 
 
268 aa  86.3  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  40.13 
 
 
260 aa  85.9  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  43.21 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.51 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  44.59 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  46.76 
 
 
202 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  32.46 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  37.16 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  42.41 
 
 
186 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  26.06 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  34.45 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.52 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  38.13 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  41.01 
 
 
242 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  32.35 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  30.87 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  34.26 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3428  peptidase A24A prepilin type IV  42.86 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  27.51 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.02 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  31.02 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  32.91 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  26.72 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  30.38 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.7 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  29.91 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  29.86 
 
 
308 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  28.7 
 
 
304 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  28.7 
 
 
300 aa  68.6  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  31.65 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.22 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  29.86 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  29.06 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  30.58 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  27.52 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.67 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1561  peptidase A24A domain protein  30.2 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  30.43 
 
 
302 aa  67  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  39.74 
 
 
218 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  31.78 
 
 
294 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  27.24 
 
 
254 aa  67  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3682  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.45 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  32.91 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  42.31 
 
 
280 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  29.41 
 
 
304 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  32.5 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  25.64 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.27 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  25.75 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  39.23 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  26.67 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.77 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  30.57 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  27.39 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  45 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5164  type 4 prepilin peptidase PilD  28.76 
 
 
290 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  32.74 
 
 
274 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  33.19 
 
 
274 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  27.43 
 
 
290 aa  63.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  26.3 
 
 
286 aa  63.2  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  29.6 
 
 
290 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0423  prepilin peptidase  29.6 
 
 
303 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  30.67 
 
 
290 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  26.28 
 
 
260 aa  62.4  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1136  peptidase A24A domain-containing protein  35.45 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  40.54 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  30.52 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  27.83 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  28 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.28 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  25.11 
 
 
289 aa  59.7  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  28.7 
 
 
290 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30 
 
 
290 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  29.58 
 
 
301 aa  58.9  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  36.67 
 
 
258 aa  58.9  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  30.77 
 
 
308 aa  58.5  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0637  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.04 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000248086  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.46 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  27.97 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  31.92 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  29.18 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  26.92 
 
 
287 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  31.47 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  28.69 
 
 
287 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  28.88 
 
 
287 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  30.9 
 
 
318 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  27.06 
 
 
259 aa  56.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>