114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1177 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 
186 aa  353  8.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  87.5 
 
 
186 aa  272  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  40.96 
 
 
274 aa  99.8  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  41.98 
 
 
268 aa  97.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  47.52 
 
 
217 aa  95.5  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  47.77 
 
 
275 aa  90.5  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  66.22 
 
 
263 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  44.14 
 
 
261 aa  89  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  39.26 
 
 
260 aa  86.3  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  55.56 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  40.12 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  33.15 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  38.46 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  32.53 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  44.31 
 
 
262 aa  71.2  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3428  peptidase A24A prepilin type IV  40.91 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  40.61 
 
 
218 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  37.82 
 
 
202 aa  63.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  33.14 
 
 
253 aa  62.8  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  42.7 
 
 
248 aa  61.6  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  34.78 
 
 
324 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  31.64 
 
 
250 aa  57.8  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  30.51 
 
 
274 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  44.44 
 
 
242 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  42.5 
 
 
255 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1419  late competence protein comC  27.92 
 
 
240 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  29.65 
 
 
244 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  36.3 
 
 
167 aa  55.5  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1199  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  27.39 
 
 
240 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1459  late competence protein comC  31.58 
 
 
240 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  32.62 
 
 
288 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1197  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  27.92 
 
 
240 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.03 
 
 
288 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  33.33 
 
 
288 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  40.74 
 
 
280 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  28.97 
 
 
254 aa  53.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  29.45 
 
 
274 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  31.13 
 
 
255 aa  52.8  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1219  late competence protein comC  27.27 
 
 
240 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1318  late competence protein comC  27.27 
 
 
240 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1395  late competence protein comC  27.27 
 
 
240 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  46.38 
 
 
250 aa  52.4  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1136  peptidase A24A domain-containing protein  54.29 
 
 
261 aa  51.6  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  31.13 
 
 
300 aa  51.6  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1221  peptidase A24A domain-containing protein  27.63 
 
 
249 aa  51.6  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.544367  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  27.03 
 
 
295 aa  51.6  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  33.71 
 
 
240 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  32.54 
 
 
318 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.29 
 
 
308 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3987  late competence protein comC  26.67 
 
 
240 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5256  peptidase A24A prepilin type IV  32.43 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.652465  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0731  peptidase A24A, prepilin type IV  34.68 
 
 
159 aa  48.5  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.465055  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  28.92 
 
 
259 aa  48.5  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.73 
 
 
259 aa  48.5  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  31.51 
 
 
291 aa  48.5  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1357  late competence protein comC  27.15 
 
 
240 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  28.74 
 
 
253 aa  48.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4158  peptidase A24A prepilin type IV  38.96 
 
 
225 aa  48.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.904391 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  25.64 
 
 
259 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  28.29 
 
 
259 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  46.48 
 
 
248 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  28.87 
 
 
263 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  34.13 
 
 
254 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  36.11 
 
 
266 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  36.11 
 
 
266 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  28.29 
 
 
308 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1335  peptidase A24A, prepilin type IV  27.65 
 
 
209 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.936907  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  30.5 
 
 
288 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.1 
 
 
283 aa  46.2  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  28.29 
 
 
304 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  30.54 
 
 
309 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  30 
 
 
308 aa  45.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  28.29 
 
 
308 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  31.58 
 
 
303 aa  45.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  28.83 
 
 
303 aa  45.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  28.29 
 
 
308 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.1 
 
 
303 aa  45.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  30.26 
 
 
302 aa  44.7  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  31.32 
 
 
280 aa  44.7  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  29.34 
 
 
303 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  25.66 
 
 
289 aa  44.7  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  28.14 
 
 
288 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.61 
 
 
265 aa  44.7  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  30.71 
 
 
286 aa  44.7  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4026  peptidase A24A prepilin type IV  38.28 
 
 
223 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.369556  hitchhiker  0.00138175 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  28.1 
 
 
303 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1154  peptidase A24A-like protein  34.23 
 
 
250 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0421152  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.22 
 
 
308 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  28.1 
 
 
303 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.22 
 
 
309 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  26.95 
 
 
288 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  28.48 
 
 
303 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  29.94 
 
 
303 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  30.77 
 
 
264 aa  43.9  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  31.11 
 
 
308 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.45 
 
 
247 aa  43.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.95 
 
 
293 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.39 
 
 
281 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  27.63 
 
 
304 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  30.95 
 
 
293 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>