185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8142 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 242 aa  457  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  34.56 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  34.63 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  35.58 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  31.78 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  41.14 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  34.25 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2579  peptidase A24A domain protein  32.42 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.691194 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  37.24 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.78 
 
 		 281 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  36.65 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  31.31 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  32.71 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  29.3 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  27.71 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  27.87 
 
 		 295 aa  75.1  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  38.1 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.88 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  34.71 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  30.52 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  25.79 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  30.53 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.84 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.57 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  29.15 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  26.34 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  31.28 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  28.7 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  27.98 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  34.01 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4462  peptidase A24A, prepilin type IV  37.56 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  29.3 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  39.72 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  29.58 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  38.21 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  41.48 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  27.85 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  30.14 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  30.05 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  34.72 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0149  peptidase A24A domain-containing protein  30.73 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  32.38 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  35.54 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  29.15 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  33.91 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  31.02 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4975  peptidase A24A prepilin type IV  36.65 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  30.23 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  26.78 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  25.82 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  28.05 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  24.18 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  31.11 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3259  prepilin peptidase  25.93 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000482568  hitchhiker  0.0000000000000925794 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.9 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1014  prepilin peptidase  25.93 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  41.61 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  38.17 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  50 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0963  type IV prepilin peptidase  25.93 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.16 
 
 		 247 aa  62  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  29.81 
 
 		 283 aa  62  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1037  peptidase A24A domain protein  32.87 
 
 		 267 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.869777 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  33.33 
 
 		 300 aa  62  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  30.7 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  30.05 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0970  prepilin peptidase  28.83 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  31.02 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  22.64 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  31.02 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1136  peptidase A24A domain-containing protein  34.54 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  24.29 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  31.08 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.51 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  29.86 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0067  prepilin peptidase  25.54 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000398253  normal  0.330687 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.08 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  21.7 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  30.59 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3529  peptidase A24 N- domain-containing protein  34.04 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  29.1 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3533  type IV prepilin leader peptidase  34.04 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.02 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2409  Prepilin peptidase  30.14 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0391481 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  30.29 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  38.96 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  33.13 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  30.28 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  23.89 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  29.95 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2533  type IV pilus prepilin peptidase PilD  33.76 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  36.48 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1134  type IV pilus prepilin peptidase PilD  32.79 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0455  type IV pilus prepilin peptidase PilD  33.76 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1313  type IV pilus prepilin peptidase PilD  33.76 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3508  type IV prepilin leader peptidase  33.76 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3249  type IV pilus prepilin peptidase PilD  33.76 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3454  Prepilin peptidase  29.75 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110375  hitchhiker  0.0033362 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  28.14 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  32.39 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>