58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0510 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0510  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 
182 aa  349  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0178991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1335  peptidase A24A, prepilin type IV  33.33 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.936907  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  28.99 
 
 
250 aa  61.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  30.4 
 
 
246 aa  59.3  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  29.1 
 
 
254 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0538  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  42.11 
 
 
250 aa  52.8  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  30.32 
 
 
303 aa  51.6  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  26.67 
 
 
260 aa  51.2  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  28.46 
 
 
248 aa  51.2  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  26.72 
 
 
274 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  29.01 
 
 
229 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3146  peptidase A24A prepilin type IV  28 
 
 
147 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2090  peptidase A24A domain protein  34.83 
 
 
245 aa  49.3  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  28.57 
 
 
254 aa  49.3  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1138  peptidase A24A domain-containing protein  30.08 
 
 
240 aa  48.5  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120004  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  29.6 
 
 
250 aa  48.5  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  24.64 
 
 
281 aa  48.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  26.39 
 
 
266 aa  47.8  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0604  peptidase A24A prepilin type IV  28.95 
 
 
147 aa  47.8  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.447619  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  26.39 
 
 
266 aa  47.8  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0992  peptidase A24A domain-containing protein  29.27 
 
 
240 aa  47.8  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0044171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  27.34 
 
 
274 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.47 
 
 
259 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  23.44 
 
 
287 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  29.69 
 
 
259 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  24.16 
 
 
270 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.3 
 
 
265 aa  45.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  30.65 
 
 
252 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  24.41 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  28.12 
 
 
248 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  26.05 
 
 
167 aa  44.7  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  25 
 
 
324 aa  44.7  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1221  peptidase A24A domain-containing protein  31.03 
 
 
249 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.544367  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  34.15 
 
 
300 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1197  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  34.48 
 
 
240 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  33.73 
 
 
244 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.43 
 
 
247 aa  43.9  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  34.43 
 
 
248 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  28.85 
 
 
255 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  28.33 
 
 
303 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1219  late competence protein comC  32.18 
 
 
240 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.99 
 
 
283 aa  43.5  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1318  late competence protein comC  32.18 
 
 
240 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  23.68 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  27.48 
 
 
304 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1395  late competence protein comC  32.18 
 
 
240 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  27.48 
 
 
308 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  27.48 
 
 
308 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  26.92 
 
 
304 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0309  peptidase A24A prepilin type IV  24.49 
 
 
162 aa  42.4  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000294051  normal  0.397426 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1199  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  28.32 
 
 
240 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1419  late competence protein comC  25.58 
 
 
240 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  26.39 
 
 
202 aa  42.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  28.67 
 
 
242 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  28.29 
 
 
286 aa  42.4  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3987  late competence protein comC  30.12 
 
 
240 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  30.21 
 
 
280 aa  41.6  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1459  late competence protein comC  25.51 
 
 
240 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>