114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1335 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1335  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 209 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.936907  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  32.52 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  33.54 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.52 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  33.75 
 
 		 248 aa  72  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  30.95 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  32.16 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0510  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0178991  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0538  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  31.85 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0244  peptidase A24A domain protein  25.86 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  35.04 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.27 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  28.07 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  29.17 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  28.37 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  49.25 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  43.06 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  29.92 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  25.9 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  37.8 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0038  peptidase A24A prepilin type IV  30.58 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  28.35 
 
 		 274 aa  54.7  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1186  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  32.84 
 
 		 282 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262365  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  25.63 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1199  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  30.71 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  27.08 
 
 		 261 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  33.04 
 
 		 168 aa  52  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  40.58 
 
 		 166 aa  52  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  26.96 
 
 		 274 aa  51.6  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1219  late competence protein comC  29.37 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.77 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1318  late competence protein comC  29.37 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  26.56 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  26.02 
 
 		 287 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  26.02 
 
 		 287 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1395  late competence protein comC  29.37 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  40.62 
 
 		 254 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  28.41 
 
 		 263 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  25.84 
 
 		 287 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1419  late competence protein comC  29.37 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1197  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  29.37 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  40.58 
 
 		 275 aa  49.3  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  22.91 
 
 		 273 aa  48.9  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  40.58 
 
 		 286 aa  48.9  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06881  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  26.42 
 
 		 267 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.05 
 
 		 269 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0731  peptidase A24A, prepilin type IV  24.81 
 
 		 159 aa  48.5  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.465055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1459  late competence protein comC  29.27 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  24.06 
 
 		 280 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  40.28 
 
 		 289 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  25.81 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  26.45 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  29.03 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  36.23 
 
 		 300 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0184  peptidase A24A, prepilin type IV  25.19 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0397814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  25.15 
 
 		 303 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  24.42 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  34.78 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.01 
 
 		 265 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1221  peptidase A24A domain-containing protein  38.24 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.544367  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1561  peptidase A24A domain protein  25.71 
 
 		 261 aa  46.2  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  27.13 
 
 		 288 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0512  peptidase A24A prepilin type IV  27.56 
 
 		 167 aa  46.2  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000304579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.68 
 
 		 288 aa  45.8  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  36.23 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  41.18 
 
 		 261 aa  45.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  25.29 
 
 		 291 aa  45.1  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  22.6 
 
 		 283 aa  45.1  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  25.88 
 
 		 288 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  39.13 
 
 		 286 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  31.65 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  30.36 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  32.86 
 
 		 297 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  30.36 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  36.23 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3416  peptidase A24A domain-containing protein  24.28 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  24 
 
 		 304 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  29.79 
 
 		 283 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  32.88 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  24.44 
 
 		 167 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1154  peptidase A24A-like protein  28.45 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0421152  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0773  prepilin peptidase  34.78 
 
 		 289 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1288  putative Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase  24.82 
 
 		 163 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0693178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5164  type 4 prepilin peptidase PilD  36.23 
 
 		 290 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0971  peptidase A24 N- domain-containing protein  26.6 
 
 		 253 aa  43.1  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  27.08 
 
 		 253 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  29.47 
 
 		 301 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  24 
 
 		 308 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  31.94 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  22.86 
 
 		 308 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  37.1 
 
 		 303 aa  42.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  26.09 
 
 		 270 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2579  peptidase A24A domain protein  22.67 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.691194 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  32 
 
 		 287 aa  42.4  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.34 
 
 		 290 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  34.83 
 
 		 305 aa  42.4  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.67 
 
 		 308 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.67 
 
 		 309 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2090  peptidase A24A domain protein  26.67 
 
 		 245 aa  42.4  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  22.86 
 
 		 308 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>