211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0184 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0184  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 166 aa  324  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0397814  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  56.36 
 
 		 166 aa  187  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  44.68 
 
 		 283 aa  110  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  41.55 
 
 		 289 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1309  Prepilin peptidase  44.44 
 
 		 283 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  43.26 
 
 		 295 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  43.28 
 
 		 309 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1480  Prepilin peptidase  45.67 
 
 		 283 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  44.44 
 
 		 318 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  43.88 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  41.43 
 
 		 289 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  43.51 
 
 		 281 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  45.65 
 
 		 303 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  39.38 
 
 		 291 aa  101  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  46.92 
 
 		 303 aa  100  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41.01 
 
 		 283 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  46.15 
 
 		 303 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  38.36 
 
 		 303 aa  99.8  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  46.15 
 
 		 303 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  46.15 
 
 		 303 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  50.46 
 
 		 290 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  43.48 
 
 		 303 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  43.48 
 
 		 303 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  43.17 
 
 		 288 aa  99  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1422  Prepilin peptidase  41.41 
 
 		 282 aa  97.8  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  41.91 
 
 		 287 aa  97.4  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  39.86 
 
 		 300 aa  97.4  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  41.91 
 
 		 287 aa  97.4  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  38.57 
 
 		 288 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  41.18 
 
 		 303 aa  96.3  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  40.43 
 
 		 302 aa  94.7  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  42.55 
 
 		 299 aa  94  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  42.86 
 
 		 296 aa  93.6  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  39.42 
 
 		 288 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  41.18 
 
 		 286 aa  91.7  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  41.61 
 
 		 287 aa  91.3  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  41.61 
 
 		 287 aa  91.3  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  40.74 
 
 		 304 aa  91.3  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  38.69 
 
 		 288 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  38.69 
 
 		 288 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  40.74 
 
 		 308 aa  90.5  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  40.74 
 
 		 308 aa  90.5  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  42 
 
 		 280 aa  90.1  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  42.11 
 
 		 289 aa  90.1  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  44.85 
 
 		 294 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  37.16 
 
 		 280 aa  88.6  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  40.44 
 
 		 286 aa  88.6  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  44.37 
 
 		 290 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  41.45 
 
 		 290 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  42.47 
 
 		 288 aa  87.8  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  40 
 
 		 304 aa  87.4  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  43.62 
 
 		 288 aa  87.4  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1391  prepilin peptidase  44.26 
 
 		 261 aa  86.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  40.82 
 
 		 266 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5164  type 4 prepilin peptidase PilD  46.46 
 
 		 290 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  46.46 
 
 		 290 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  40.82 
 
 		 266 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0773  prepilin peptidase  47.47 
 
 		 289 aa  87  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0149  peptidase A24A domain-containing protein  43.85 
 
 		 306 aa  87  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  43.24 
 
 		 296 aa  85.5  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  38.3 
 
 		 287 aa  85.5  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  38.3 
 
 		 287 aa  85.5  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  42.07 
 
 		 293 aa  85.5  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0392  peptidase A24A, prepilin type IV  39.46 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.354362 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  38.51 
 
 		 283 aa  85.9  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3638  leader peptidase HopD  43.85 
 
 		 155 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000886735  normal  0.214059 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  43.75 
 
 		 293 aa  84.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3711  leader peptidase HopD  43.85 
 
 		 155 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00474586  normal  0.728501 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2533  type IV pilus prepilin peptidase PilD  45.93 
 
 		 304 aa  84.3  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0455  type IV pilus prepilin peptidase PilD  45.93 
 
 		 304 aa  84.3  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1014  prepilin peptidase  37.14 
 
 		 280 aa  84.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1313  type IV pilus prepilin peptidase PilD  45.93 
 
 		 304 aa  84.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3508  type IV prepilin leader peptidase  45.93 
 
 		 304 aa  84.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3249  type IV pilus prepilin peptidase PilD  45.93 
 
 		 304 aa  84.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3259  prepilin peptidase  37.14 
 
 		 301 aa  84  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000482568  hitchhiker  0.0000000000000925794 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3533  type IV prepilin leader peptidase  45.93 
 
 		 304 aa  84  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4241  prepilin peptidase  40.74 
 
 		 287 aa  84  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0963  type IV prepilin peptidase  37.14 
 
 		 277 aa  84.3  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  42.96 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3529  peptidase A24 N- domain-containing protein  45.93 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1134  type IV pilus prepilin peptidase PilD  45.93 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  41.01 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3454  Prepilin peptidase  41.79 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110375  hitchhiker  0.0033362 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3806  A24 family peptidase  39.68 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000259026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0843  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41.01 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120524  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3638  type III leader peptidase  43.94 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105131  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3746  type III leader peptidase  43.94 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00764822  normal  0.0487267 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3809  type III leader peptidase  43.94 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00060894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4646  peptidase, A24 (type IV prepilin peptidase) family  39.84 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000049764  normal  0.0336249 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3618  A24 family peptidase  39.84 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960523  hitchhiker  0.00521455 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  38.51 
 
 		 308 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  44.12 
 
 		 290 aa  81.3  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3072  Prepilin peptidase  42.97 
 
 		 293 aa  80.9  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.373458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41.18 
 
 		 308 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  39.29 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  39.01 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  44.21 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  44.21 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.29 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  42.86 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>