170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0392 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0392  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 
160 aa  304  4.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.354362 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2122  peptidase A24A domain-containing protein  43.75 
 
 
255 aa  88.2  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.711302  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0184  peptidase A24A, prepilin type IV  40.14 
 
 
166 aa  87.4  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0397814  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  39.86 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  39.33 
 
 
300 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1527  peptidase A24A domain protein  47.06 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.295629 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  37.16 
 
 
304 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  38.26 
 
 
308 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  38.26 
 
 
308 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  37.58 
 
 
304 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1480  Prepilin peptidase  43.2 
 
 
283 aa  77.4  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  37.58 
 
 
303 aa  77  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  39.61 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  41.67 
 
 
288 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  38.26 
 
 
287 aa  74.7  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1309  Prepilin peptidase  40.43 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  36.31 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  36.17 
 
 
286 aa  71.6  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1391  prepilin peptidase  38.21 
 
 
261 aa  70.9  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  42.64 
 
 
296 aa  71.2  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  35.21 
 
 
289 aa  71.2  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.69 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  36.31 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  42.86 
 
 
308 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  42.86 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  34.84 
 
 
302 aa  68.6  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  37.14 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  39.01 
 
 
290 aa  68.2  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.31 
 
 
283 aa  67.4  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  38.67 
 
 
291 aa  67.4  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3806  A24 family peptidase  39.69 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000259026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  36.55 
 
 
288 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3809  type III leader peptidase  41.41 
 
 
155 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00060894  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3638  type III leader peptidase  41.41 
 
 
155 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105131  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3746  type III leader peptidase  41.41 
 
 
155 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00764822  normal  0.0487267 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3638  leader peptidase HopD  40.74 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000886735  normal  0.214059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  39.13 
 
 
318 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  35.56 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3711  leader peptidase HopD  41.41 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00474586  normal  0.728501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  36.55 
 
 
288 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  32.9 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2902  peptidase A24A prepilin type IV  40.16 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3618  A24 family peptidase  39.85 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960523  hitchhiker  0.00521455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  35.42 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1014  prepilin peptidase  33.09 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4646  peptidase, A24 (type IV prepilin peptidase) family  39.69 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000049764  normal  0.0336249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  44.8 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  44.8 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  44.8 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  35.66 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  34.59 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0963  type IV prepilin peptidase  33.09 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  36.43 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  40.95 
 
 
308 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3259  prepilin peptidase  33.09 
 
 
301 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000482568  hitchhiker  0.0000000000000925794 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  44 
 
 
303 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3529  type 4 prepilin peptidase  42.06 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.645409  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03186  bifunctional prepilin leader peptidase/ methylase  42.06 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0378  peptidase A24A prepilin type IV  42.06 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03137  hypothetical protein  42.06 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0378  peptidase A24A prepilin type IV  42.06 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.735955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1422  Prepilin peptidase  36.07 
 
 
282 aa  65.1  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  42.18 
 
 
303 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  37.23 
 
 
291 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  44.85 
 
 
296 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  36.69 
 
 
309 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  37.86 
 
 
283 aa  64.3  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  40.43 
 
 
303 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  39.72 
 
 
303 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  38.32 
 
 
308 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  40.69 
 
 
293 aa  63.9  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.88 
 
 
308 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  40.69 
 
 
293 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  37.5 
 
 
301 aa  63.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.64 
 
 
299 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  33.56 
 
 
288 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.41 
 
 
280 aa  62.4  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0149  peptidase A24A domain-containing protein  36.13 
 
 
306 aa  62  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4241  prepilin peptidase  37.41 
 
 
287 aa  60.8  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  38.52 
 
 
289 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  35.16 
 
 
263 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  38.36 
 
 
266 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  38.36 
 
 
266 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  39.72 
 
 
294 aa  60.5  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  34.67 
 
 
258 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  32.24 
 
 
287 aa  59.7  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  32.24 
 
 
287 aa  59.7  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  38.57 
 
 
294 aa  58.9  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  40 
 
 
293 aa  58.9  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3131  peptidase A24A domain protein  41.09 
 
 
260 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1288  putative Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase  34.44 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0693178  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  39.39 
 
 
294 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.21 
 
 
259 aa  58.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  38.53 
 
 
289 aa  58.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.72 
 
 
290 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  34.93 
 
 
308 aa  57.8  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2409  Prepilin peptidase  37.41 
 
 
257 aa  57.4  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0391481 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  31.25 
 
 
261 aa  57.4  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0773  prepilin peptidase  40.21 
 
 
289 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0013  Peptidase A24 N- domain protein  40 
 
 
274 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.846368 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>