55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4026 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4026  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 223 aa  417  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.369556  hitchhiker  0.00138175 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  38.26 
 
 		 274 aa  92  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  43.84 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  39.74 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  38.1 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  36.71 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  35.85 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  36.31 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  33.14 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  33.53 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  41.5 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  33.97 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  39.22 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  39.86 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  37.93 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  39.64 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  33.08 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.37 
 
 		 281 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  45.26 
 
 		 280 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  25.77 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  45.36 
 
 		 255 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  28.99 
 
 		 288 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  28.4 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  27.62 
 
 		 288 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4462  peptidase A24A, prepilin type IV  39.02 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  27.92 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  29.22 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  33.77 
 
 		 324 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  33.33 
 
 		 248 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  26.62 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  30.13 
 
 		 290 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  28.89 
 
 		 288 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3428  peptidase A24A prepilin type IV  39.05 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  30 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5256  peptidase A24A prepilin type IV  38.73 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.652465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  24.05 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  27.5 
 
 		 288 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  40.14 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  24.54 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  30.4 
 
 		 274 aa  45.4  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  28.89 
 
 		 253 aa  45.1  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  26.76 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.63 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  30.77 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  29.77 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15430  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  35.09 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  32.87 
 
 		 296 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  27.44 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  27.56 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  28.12 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3618  A24 family peptidase  29.86 
 
 		 155 aa  43.5  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960523  hitchhiker  0.00521455 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  22.49 
 
 		 289 aa  42.4  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  32.61 
 
 		 283 aa  42.4  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  26.67 
 
 		 264 aa  42  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4646  peptidase, A24 (type IV prepilin peptidase) family  29.17 
 
 		 155 aa  42  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000049764  normal  0.0336249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>