26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3139 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3139  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 197 aa  357  7e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  32.51 
 
 		 274 aa  78.2  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  40 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  40.97 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  40 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  39.53 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  36.62 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  37.23 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  36.55 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  41.73 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  36.36 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4158  peptidase A24A prepilin type IV  38.3 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.904391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5256  peptidase A24A prepilin type IV  36.24 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.652465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  39.16 
 
 		 324 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  34.51 
 
 		 268 aa  48.5  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  35.25 
 
 		 242 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  38.76 
 
 		 262 aa  48.1  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  41.32 
 
 		 280 aa  47.8  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3404  peptidase A24A prepilin type IV  31.62 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  36.8 
 
 		 254 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  30.6 
 
 		 242 aa  44.7  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  32.5 
 
 		 186 aa  44.7  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4462  peptidase A24A, prepilin type IV  39.39 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  47.06 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  40.5 
 
 		 255 aa  41.2  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3759  peptidase A24A, prepilin type IV  37.4 
 
 		 147 aa  41.2  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal  0.405362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>