32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3404 on replicon NC_013531
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013531  Xcel_3404  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 212 aa  381  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  40 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  45.93 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  37.61 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  39.85 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  40.41 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  42.95 
 
 		 275 aa  61.6  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  39.46 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  41.94 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  31.28 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  33.57 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  31.03 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  34.59 
 
 		 248 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  35.86 
 
 		 260 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2754  peptidase A24A prepilin type IV  37.39 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000857279  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  39.19 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  38.46 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  36.22 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  46.67 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3428  peptidase A24A prepilin type IV  45.04 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  34.97 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  30.52 
 
 		 274 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  42.44 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  29.8 
 
 		 300 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1719  hypothetical protein  31.41 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  31.43 
 
 		 265 aa  43.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  32.59 
 
 		 167 aa  42.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  35.88 
 
 		 280 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  32.3 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.14 
 
 		 281 aa  42.4  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4462  peptidase A24A, prepilin type IV  42.28 
 
 		 249 aa  41.6  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1980  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 142 aa  41.6  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>