36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2644 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2644  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 
150 aa  276  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3759  peptidase A24A, prepilin type IV  73.11 
 
 
147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal  0.405362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2350  peptidase A24A, prepilin type IV  66.39 
 
 
133 aa  133  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.747166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2397  peptidase A24A, prepilin type IV  66.39 
 
 
133 aa  133  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2391  peptidase A24A, prepilin type IV  66.39 
 
 
133 aa  133  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.300874  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12572  hypothetical protein  60 
 
 
139 aa  115  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000763367  normal  0.175513 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1980  peptidase A24A prepilin type IV  47.79 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175431  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15430  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  37.69 
 
 
218 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5256  peptidase A24A prepilin type IV  36.29 
 
 
194 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.652465  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  37.31 
 
 
253 aa  54.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  40.16 
 
 
167 aa  51.2  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  34.13 
 
 
229 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  35.71 
 
 
261 aa  50.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  44.44 
 
 
254 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3428  peptidase A24A prepilin type IV  40.62 
 
 
223 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  32.26 
 
 
287 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1391  prepilin peptidase  29.5 
 
 
261 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  28.03 
 
 
287 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  28.67 
 
 
166 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  34.11 
 
 
287 aa  43.5  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  34.11 
 
 
287 aa  43.5  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  34.38 
 
 
220 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  30.5 
 
 
289 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  27.86 
 
 
300 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  28.23 
 
 
255 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  31.97 
 
 
318 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  30.71 
 
 
274 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  33.59 
 
 
283 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2211  peptidase A24A prepilin type IV  44.29 
 
 
222 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144961  normal  0.829698 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  29.08 
 
 
289 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  28.76 
 
 
309 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  35.88 
 
 
275 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  30.07 
 
 
303 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  34.92 
 
 
260 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  30.7 
 
 
246 aa  40  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  29.37 
 
 
253 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>