13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12572 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12572  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  255  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000763367  normal  0.175513 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2350  peptidase A24A, prepilin type IV  66.12 
 
 		 133 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.747166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2397  peptidase A24A, prepilin type IV  66.12 
 
 		 133 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2391  peptidase A24A, prepilin type IV  66.12 
 
 		 133 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.300874  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2644  peptidase A24A, prepilin type IV  59.4 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3759  peptidase A24A, prepilin type IV  56.2 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal  0.405362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1980  peptidase A24A prepilin type IV  47.06 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175431  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5256  peptidase A24A prepilin type IV  42.74 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.652465  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15430  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  34.38 
 
 		 218 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  39.52 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  30.58 
 
 		 253 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  41.1 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  27.2 
 
 		 254 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>