28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1980 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1980  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 142 aa  262  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2644  peptidase A24A, prepilin type IV  46.32 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3759  peptidase A24A, prepilin type IV  45.45 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal  0.405362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2350  peptidase A24A, prepilin type IV  41.18 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.747166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2397  peptidase A24A, prepilin type IV  41.18 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2391  peptidase A24A, prepilin type IV  41.18 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.300874  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  30.47 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  32.79 
 
 		 246 aa  53.5  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12572  hypothetical protein  44.85 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000763367  normal  0.175513 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  28.79 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  35.51 
 
 		 242 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  39.6 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  37.37 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  26.9 
 
 		 274 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  34.48 
 
 		 189 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  30.5 
 
 		 287 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  35.25 
 
 		 287 aa  42.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  30.5 
 
 		 287 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  26.09 
 
 		 263 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7226  peptidase A24A prepilin type IV  38.68 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.22284 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  28.57 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  31.88 
 
 		 287 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.01 
 
 		 288 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  31.75 
 
 		 248 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  26.95 
 
 		 274 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  32.12 
 
 		 260 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  36.14 
 
 		 194 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  37.72 
 
 		 167 aa  40  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>