134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0796 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 183 aa  364  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  32.92 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  35.15 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  31.18 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  35 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  33.54 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  37.84 
 
 		 145 aa  72  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  31.33 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  29.75 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  31.14 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  36.2 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  31.15 
 
 		 289 aa  62  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  27.49 
 
 		 179 aa  62  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  30.63 
 
 		 204 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6375  peptidase A24A prepilin type IV  32.16 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  30.63 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5501  peptidase A24A, prepilin type IV  31.52 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6787  peptidase A24A, prepilin type IV  31.52 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  30.63 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7226  peptidase A24A prepilin type IV  31.43 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.22284 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  31.15 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  27.53 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  31.06 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7204  peptidase A24A, prepilin type IV  29.71 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119785  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  32.7 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2480  peptidase A24A prepilin type IV  27.67 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139077 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  32.93 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  31.33 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  29.94 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  31.97 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  36.07 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  31.54 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  44.71 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  33.88 
 
 		 303 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2358  hypothetical protein  33.55 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  28.57 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  33.61 
 
 		 296 aa  52  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  29.27 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  35.8 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  35.8 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  35.8 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  34 
 
 		 318 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2743  peptidase A24A prepilin type IV  27.54 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  33.33 
 
 		 263 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0545  prepilin peptidase CpaA  35.8 
 
 		 142 aa  48.9  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.26 
 
 		 283 aa  48.5  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  41.54 
 
 		 175 aa  48.5  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  33.33 
 
 		 303 aa  48.5  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0657  prepilin peptidase transmembrane protein  31 
 
 		 172 aa  48.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6385  normal  0.502412 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  35.79 
 
 		 246 aa  48.1  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  35.4 
 
 		 302 aa  48.1  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1480  Prepilin peptidase  28.23 
 
 		 283 aa  48.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  31.45 
 
 		 308 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  31.45 
 
 		 308 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  34.91 
 
 		 291 aa  48.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  34.48 
 
 		 274 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.33 
 
 		 259 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1422  Prepilin peptidase  30.4 
 
 		 282 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  30.65 
 
 		 304 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5627  peptidase A24A prepilin type IV  29.93 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0178766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  32.17 
 
 		 300 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.58 
 
 		 265 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4222  Prepilin peptidase  35.59 
 
 		 321 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  56.1 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  40.26 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  34.21 
 
 		 259 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1745  Flp pilus assembly protein, protease CpaA  31.41 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  30.86 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  34.58 
 
 		 288 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  32 
 
 		 309 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  34.58 
 
 		 288 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.51 
 
 		 288 aa  45.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2165  peptidase A24A, prepilin type IV  29.09 
 
 		 166 aa  45.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065681 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  26.49 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0184  peptidase A24A, prepilin type IV  26.89 
 
 		 166 aa  45.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0397814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  32.5 
 
 		 308 aa  45.1  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  30.82 
 
 		 255 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  30.65 
 
 		 304 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  35.09 
 
 		 294 aa  45.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  54.76 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32 
 
 		 303 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  31.9 
 
 		 274 aa  44.7  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1309  Prepilin peptidase  25.76 
 
 		 283 aa  45.1  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0149  peptidase A24A domain-containing protein  29.91 
 
 		 306 aa  44.7  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  34.65 
 
 		 266 aa  44.3  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  34.65 
 
 		 266 aa  44.3  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  31.58 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.25 
 
 		 280 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.91 
 
 		 308 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1400  peptidase A24A, prepilin type IV  54.76 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  31.58 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  34.51 
 
 		 283 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  31.58 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  31.58 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4862  hypothetical protein  30.08 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0540679  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  23.4 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  35.59 
 
 		 258 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  28.7 
 
 		 260 aa  44.3  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  30.25 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>