46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2165 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2165  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 166 aa  313  7e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065681 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  37.67 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55800  hypothetical protein  31.45 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0841  peptidase A24A prepilin type IV  42.73 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0575  hypothetical protein  34.34 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0614  peptidase A24A, prepilin type IV  34.34 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0179326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0620  peptidase A24A prepilin type IV  33.73 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450509 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  29.38 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4589  peptidase A24A prepilin type IV  30.91 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  36.89 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  37.61 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  37.61 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2318  peptidase A24A prepilin type IV  35.92 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20935 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  39.22 
 
 		 189 aa  48.1  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3759  peptidase A24A, prepilin type IV  38.1 
 
 		 147 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal  0.405362 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  32.32 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0639  peptidase A24A, prepilin type IV  32.43 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1980  peptidase A24A prepilin type IV  36.44 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175431  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  36.18 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7226  peptidase A24A prepilin type IV  35.4 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.22284 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  36.7 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  33.55 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  36.7 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  36.7 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  36.7 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  36.7 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4443  peptidase A24A prepilin type IV  34.55 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  33.58 
 
 		 157 aa  44.7  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  34.31 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4375  peptidase A24A, prepilin type IV  33.78 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  33.91 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5406  peptidase A24A, prepilin type IV  28.82 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  35.2 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2374  hypothetical protein  32.89 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1707  peptidase A24A prepilin type IV  36.36 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.394739 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2329  peptidase A24A prepilin type IV  33.55 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  36.54 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  32.26 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  40.45 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  32.26 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2708  hypothetical protein  34.46 
 
 		 147 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.133266  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  37.66 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  43.42 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0951  peptidase A24A, prepilin type IV  30.77 
 
 		 142 aa  40.4  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4646  peptidase, A24 (type IV prepilin peptidase) family  32.1 
 
 		 155 aa  40.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000049764  normal  0.0336249 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  38.04 
 
 		 165 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>