33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0951 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0951  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 142 aa  278  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  36.36 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  32.61 
 
 		 296 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  33.81 
 
 		 263 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  33.33 
 
 		 295 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  31.01 
 
 		 287 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  31.78 
 
 		 287 aa  47  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1391  prepilin peptidase  35.2 
 
 		 261 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  36.54 
 
 		 218 aa  45.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  29.63 
 
 		 281 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  37.96 
 
 		 266 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  37.96 
 
 		 266 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  31.62 
 
 		 287 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  31.62 
 
 		 287 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  32.82 
 
 		 289 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  31.58 
 
 		 289 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.5 
 
 		 273 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.82 
 
 		 259 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0184  peptidase A24A, prepilin type IV  35 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0397814  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1309  Prepilin peptidase  34.34 
 
 		 283 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1014  prepilin peptidase  31.45 
 
 		 280 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0963  type IV prepilin peptidase  31.45 
 
 		 277 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3259  prepilin peptidase  31.45 
 
 		 301 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000482568  hitchhiker  0.0000000000000925794 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  33.58 
 
 		 274 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  31.78 
 
 		 294 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0269  peptidase A24B, FlaK-like protein  33.33 
 
 		 234 aa  41.6  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.205091  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0392  peptidase A24A, prepilin type IV  35.71 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.354362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.83 
 
 		 280 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  33.67 
 
 		 283 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  32.77 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.85 
 
 		 288 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3012  peptidase A24A, prepilin type IV  30.3 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  31.3 
 
 		 300 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>