17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0639 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0639  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 156 aa  306  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0620  peptidase A24A prepilin type IV  51.28 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0575  hypothetical protein  50 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0614  peptidase A24A, prepilin type IV  50 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0179326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4589  peptidase A24A prepilin type IV  51.28 
 
 		 156 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0841  peptidase A24A prepilin type IV  50.33 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4375  peptidase A24A, prepilin type IV  51.28 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4835  hypothetical protein  51.92 
 
 		 157 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55800  hypothetical protein  34.27 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4862  hypothetical protein  31.75 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0540679  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  33 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  27.52 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  38.54 
 
 		 194 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2165  peptidase A24A, prepilin type IV  36.54 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065681 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  30.52 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  35.35 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0603  type IV prepilin peptidase family protein  29.67 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>