29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0603 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0603  type IV prepilin peptidase family protein  100 
 
 		 132 aa  253  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0687  peptidase A24A prepilin type IV  92.42 
 
 		 140 aa  198  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0254  type IV prepilin peptidase family protein  92.39 
 
 		 93 aa  149  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000335319  hitchhiker  0.00000137879 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0367  type IV leader peptidase  28.46 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0321504  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03359  prepilin peptidase CpaA  33.33 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  33.86 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  31.5 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  34.03 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  30.71 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  31.2 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  32.84 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3485  peptidase A24A prepilin type IV  27.7 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  27.27 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3500  peptidase A24A, prepilin type IV  27.83 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.590654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  32.14 
 
 		 170 aa  43.9  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  25.97 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  34.52 
 
 		 170 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0062  peptidase A24B, FlaK-like  31.63 
 
 		 252 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  35.38 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  29.91 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06198  prepilin peptidase CpaA  35.63 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  26.28 
 
 		 159 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0620  peptidase A24A prepilin type IV  32.38 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1528  hypothetical protein  27.91 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  32.99 
 
 		 185 aa  40.8  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0603  peptidase A24A prepilin type IV  31.01 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2689  peptidase A24A prepilin type IV  31.82 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  25.53 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0841  peptidase A24A prepilin type IV  28.89 
 
 		 146 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>