14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0254 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0254  type IV prepilin peptidase family protein  100 
 
 		 93 aa  179  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000335319  hitchhiker  0.00000137879 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0687  peptidase A24A prepilin type IV  98.91 
 
 		 140 aa  177  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0603  type IV prepilin peptidase family protein  92.39 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03359  prepilin peptidase CpaA  37.66 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  37.33 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  33.64 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  30.95 
 
 		 170 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0367  type IV leader peptidase  28.24 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0321504  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3500  peptidase A24A, prepilin type IV  41.18 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.590654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  33.68 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0603  peptidase A24A prepilin type IV  37.33 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  31.71 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  32.94 
 
 		 170 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  36.47 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>