30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0687 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0687  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 140 aa  270  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0603  type IV prepilin peptidase family protein  92.42 
 
 		 132 aa  237  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0254  type IV prepilin peptidase family protein  98.91 
 
 		 93 aa  177  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000335319  hitchhiker  0.00000137879 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0367  type IV leader peptidase  28.47 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0321504  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03359  prepilin peptidase CpaA  34.03 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  36.22 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  30.07 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  31.94 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  33.07 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3500  peptidase A24A, prepilin type IV  35.4 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.590654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  23.87 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  27.66 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  28 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  26.19 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3485  peptidase A24A prepilin type IV  28.38 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  27.48 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  34.74 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  34.12 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1528  hypothetical protein  28.41 
 
 		 184 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0603  peptidase A24A prepilin type IV  38.67 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2689  peptidase A24A prepilin type IV  33.64 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0062  peptidase A24B, FlaK-like  29.59 
 
 		 252 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  30.89 
 
 		 246 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  23.72 
 
 		 174 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  22.58 
 
 		 174 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  25.95 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0620  peptidase A24A prepilin type IV  31.43 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450509 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  27.43 
 
 		 189 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  24.84 
 
 		 170 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>