47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0417 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 165 aa  305  3e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  42.95 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  42.57 
 
 		 172 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  41.14 
 
 		 168 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  40.26 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  41.67 
 
 		 168 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  38.71 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  37.72 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  37.14 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  38.96 
 
 		 174 aa  77  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  41.06 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  40.71 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  38.41 
 
 		 174 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  37.58 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  38.06 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  39.61 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  37.75 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  35.76 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  40.52 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5127  peptidase A24A prepilin type IV  35.77 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0993185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  38.16 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  37.61 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  31.91 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4094  peptidase A24A, prepilin type IV  37.93 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  39.77 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0610  peptidase A24A, prepilin type IV  36.42 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.361239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  37.42 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  34.48 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  35.45 
 
 		 183 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  43.75 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2040  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0329239  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  38.14 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0665  peptidase A24A prepilin type IV  34.55 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  40 
 
 		 168 aa  47.4  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  32.87 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  26.42 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  31.61 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  49.12 
 
 		 248 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  33.12 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4406  peptidase A24A prepilin type IV  32.69 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3485  peptidase A24A prepilin type IV  32.21 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3791  peptidase A24A prepilin type IV  35.14 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  32.87 
 
 		 159 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3033  peptidase A24A, prepilin type IV  41.89 
 
 		 167 aa  42  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  36.36 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  33.8 
 
 		 218 aa  40.8  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>